叔叔有案底通常不会影响侄子当兵，但特殊情况下可能产生一定影响。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般情况下的影响分析

在征兵政治审查工作中，主要关注的是应征公民本人及其直系亲属（包括父母、配偶、子女、未婚兄弟姐妹等）以及与本人关系密切或影响较大的旁系亲属（如祖父母、外祖父母）的现实表现。根据我国目前现有的法律法规，并没有明确规定直系亲属或旁系亲属有犯罪记录会直接导致其子女或隔代亲属不能参军入伍。因此，一般情况下，叔叔作为侄子的旁系亲属，其案底不会直接影响侄子当兵的资格。

二、特殊情况下的影响分析

尽管一般情况下叔叔的案底不会影响侄子当兵，但也存在特殊情况。如果侄子与叔叔共同生活且受其影响较大，同时叔叔存在危害国家安全等严重犯罪行为的案底，这种情况下可能会对侄子当兵产生一定的影响。这是因为政治审查会综合考虑应征公民的家庭背景、社会关系以及个人品质等多方面因素。此外，如果直系血亲或对侄子有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的情况，也可能导致政审不合格。

三、建议与注意事项

1. 提前咨询：如果你有意参军，建议提前咨询当地的征兵机构或相关部门，了解具体的征兵政策和要求，以确保自己符合所有条件。
2. 关注个人品行：无论叔叔是否有案底，你都应关注自己的品行和健康状况，努力提升自己的综合素质，为顺利参军做好充分准备。
3. 了解政审标准：政治审查是参军过程中的重要环节，了解政审的标准和流程有助于你更好地准备政审环节，提高成功入伍的几率。

综上所述，叔叔有案底是否会影响侄子当兵，需要具体情况具体分析。在政治审查过程中，征兵部门会根据实际情况进行综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。