结论前置：电动自行车追尾机动车后，若机动车驾驶人在不知情的情况下开车离开，该行为一般不构成交通肇事逃逸。但具体是否构成逃逸，还需结合实际情况和证据进行综合判断。
详细分析：
交通肇事逃逸的定义：
- 根据《道路交通事故处理程序规定》及《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通肇事逃逸是指发生道路交通事故后，当事人为逃避法律责任，驾驶或者遗弃车辆逃离道路交通事故现场以及潜逃藏匿的行为。关键在于肇事者是否明知发生了交通事故而有意逃离现场。
不知情情况下的离开：
- 在您描述的情况中，机动车驾驶人在不知情的情况下开车离开，由于缺乏“明知”这一要素，即驾驶人并不知道发生了交通事故，因此该行为通常不被认定为交通肇事逃逸。
可能的情况与证据：
- 情况一：若电动自行车追尾后，机动车驾驶人确实未察觉到事故发生，且现场无其他目击者或监控视频等证据证明驾驶人知情，那么驾驶人离开现场的行为一般不构成逃逸。
- 情况二：若现场有目击者或监控视频等证据显示，机动车驾驶人在追尾后有所察觉（如听到碰撞声、看到后视镜中的异常等），但选择离开现场，那么该行为可能被认定为逃逸。此时，驾驶人的主观意图将成为判断的关键。
法律责任：
- 若机动车驾驶人的行为不构成逃逸，那么其一般只需承担因追尾事故造成的相应民事赔偿责任，如赔偿电动自行车的维修费用等。
- 若机动车驾驶人的行为被认定为逃逸，那么其除了需承担民事赔偿责任外，还可能面临行政处罚，如罚款、拘留等。情节严重的，甚至可能构成犯罪，需承担刑事责任。
法律建议：
- 对于电动自行车驾驶人：在发生追尾事故后，应立即停车、保护现场、抢救受伤人员（如有）并报警处理。同时，尽量收集现场证据，如拍照、录像、寻找目击者等，以便后续维权。
- 对于机动车驾驶人：在行驶过程中应保持高度警惕，注意观察周围环境。若发生事故，无论是否知情，都应立即停车检查并报警处理。避免因不知情而离开现场后，被误认为逃逸而承担不必要的法律责任。
总结：电动自行车追尾机动车后，机动车驾驶人在不知情的情况下开车离开，该行为一般不构成交通肇事逃逸。但具体是否构成逃逸，还需结合实际情况和证据进行综合判断。因此，在处理此类事故时，建议双方都保持冷静、理性，并尽快报警处理，以便警方能够及时调查取证并作出公正的处理决定。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。