结论：公证时房产证上的车位是否算面积，主要取决于车位是否具有独立的产权，且该产权是否被明确登记在房产证上。若车位有独立产权且已登记，则算面积且合法；若车位无独立产权或未登记，则不算面积，但公证行为本身仍合法，只是不涉及车位面积。
分析说明：
车位有独立产权且已登记在房产证上：
- 在这种情况下，车位被视为房产的一部分，具有独立的产权证明，且该产权已被明确登记在房产证上。因此，在公证时，车位面积会被计入房产的总面积中。这种做法是合法的，因为车位作为房产的附属部分，其产权和面积都受到了法律的明确保护。
车位无独立产权或未登记在房产证上：
- 如果车位没有独立的产权证明，或者其产权未被登记在房产证上，那么在公证时，车位面积通常不会被计入房产的总面积中。这并不意味着公证行为本身不合法，而是说公证的内容仅限于房产证上明确登记的部分。对于未登记的车位，其产权和使用权可能受到其他法律条款的约束，如物业管理规定、业主公约等。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》及相关房产管理法规，房产证是证明房产所有权的重要法律文件。房产证上登记的内容，包括房产的面积、结构、用途等，都具有法律效力。因此，在公证时，应严格按照房产证上登记的内容进行公证。
- 建议：如果您在公证时遇到车位面积是否算入房产总面积的问题，首先应查看房产证上是否明确登记了车位的产权和面积。如果登记了，那么车位面积应计入房产总面积；如果未登记，则不应计入。同时，您也可以咨询当地的房产管理部门或公证机构，以获取更具体的指导和建议。
特殊情况说明：
- 在某些特殊情况下，如车位是通过租赁或使用权转让等方式获得的，那么车位的使用权可能并不包含在房产证上登记的产权范围内。在这种情况下，公证时通常不会涉及车位面积的计算。但如果您对车位的使用权有争议或需要进一步明确，建议咨询专业律师以获取法律帮助。
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