行政案件查实但已超过法定起诉期限的，通常无法再通过行政诉讼途径解决，但可尝试通过行政复议、申诉或协商途径寻求救济，具体需结合案件类型和实际情况判断。以下分情况详细说明：

1. 若案件属于行政诉讼受案范围且已过起诉期限
   根据《行政诉讼法》第四十六条，公民、法人或其他组织直接向法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道行政行为作出之日起六个月内提出（法律另有规定的除外）。若已超过该期限，法院将不予受理。此时需重点核查：

   • 是否存在起诉期限延长情形：如因不可抗力或其他正当理由耽误期限，可在障碍消除后十日内申请延长，但需提供证据证明（如自然灾害、突发疾病等导致无法及时起诉）。
     
   • 是否涉及不动产案件：因不动产提起诉讼的，起诉期限为二十年，自行政行为作出之日起计算，此类案件可能仍有救济空间。
     

2. 若案件属于行政复议范围且未超复议期限
   行政复议期限通常为知道行政行为之日起六十日内（法律另有规定的除外）。若未超过复议期限，可向上一级行政机关或法定复议机构申请复议，要求撤销或变更原行政行为。

   • 复议优势：复议机关可对原行政行为的合法性与合理性进行全面审查，且复议程序相对灵活，可能通过调解、和解等方式解决争议。
     
   • 注意：若已超过复议期限，复议机关将不予受理，此时需转向其他途径。

3. 若案件涉及行政赔偿且未超赔偿请求期限
   根据《国家赔偿法》，赔偿请求人请求国家赔偿的时效为两年，自知道或应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯其人身权、财产权之日起计算。若行政行为已被查实违法且造成损害，即使原行政诉讼或复议期限已过，仍可在赔偿时效内单独提起赔偿请求。

   • 操作建议：需先确认行政行为已被有权机关确认为违法（如通过复议决定、法院生效裁判等），再向赔偿义务机关提出赔偿申请，若被拒绝可向法院提起赔偿诉讼。

4. 其他救济途径：申诉、信访或协商

   • 申诉：向作出行政行为的机关或其上级机关提出申诉，要求重新审查案件，但申诉无严格程序限制，结果具有不确定性。
     
   • 信访：通过信访渠道反映问题，但信访不直接启动法律程序，需结合其他途径使用。
     
   • 协商：与行政机关直接沟通，争取通过补正、撤销或变更行政行为等方式解决争议，适用于行政机关愿意配合的情形。

行动建议：

• 第一步：梳理案件关键时间节点（如行政行为作出时间、知道时间、起诉/复议期限截止时间），确认是否确实已过期。
  
• 第二步：根据案件类型（如处罚、许可、征收等）选择对应救济途径，优先尝试复议或赔偿请求。
  
• 第三步：准备证据材料（如行政行为文书、知道时间的证明、损害后果证据等），确保救济申请有充分依据。
  

若有具体案件细节（如行政行为类型、时间节点、损害情况等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的解决方案。