当在总价合同中遇到工程量清单缺项的情况时，我们可以遵循以下综合策略来处理，以确保整个过程的合法、公平且高效：

一、首要依据合同约定

首先，我们需要仔细审查合同内容，看其中是否对工程量清单缺项的处理方式有明确约定。如果合同中有相关规定，那么我们就应严格按照合同约定来执行，因为合同约定是具有法律约束力的。例如，若合同中规定新增项目单价应参照合同内类似项目单价执行，那么在实际操作中，我们就应依此来办理。

二、合同无约定时的处理

如果合同中没有对工程量清单缺项的处理方式做出明确约定，那么我们就需要参照相关的法律法规和计价规范来处理。

1. 确定综合单价与计算费用：

   • 承包人可以提出一个综合单价，这个单价需要经过发包人的确认后，才能用来调整合同价款。
   • 或者，双方也可以按照成本加利润的原则来协商一个新的价格。
   • 在计算工程量及费用时，承包人需要计量实际完成的工程量，并经过发包人或其委托的监理工程师核实后，根据综合单价来计算费用，并据此调整合同价款。
   • 这一过程中，我们需要遵循《建设工程工程量清单计价规范》（GB 50500 - 2013）等相关规定。

2. 遵循公平合理原则协商处理：

   • 在双方没有合同约定的情况下，应秉持公平合理的原则进行协商。
   • 可以参考类似工程的造价和市场行情来确定漏项的价格和费用。例如，在一个小型装修工程中，如果漏列了卫生间浴霸的安装项目，那么我们可以参考当地同类型工程的费用来协商确定。

3. 必要时进行工程造价鉴定：

   • 如果双方无法就漏项的费用达成一致意见，那么可以共同委托一个有资质的工程造价咨询机构来进行鉴定。
   • 鉴定结果将作为解决争议的参考依据。这种方法特别适用于大型商业建筑工程等复杂项目中漏项费用的争议解决。

三、注重证据收集与管理

在处理工程量清单缺项的过程中，双方都需要收集和保存相关的证据，以支持各自的主张。这些证据可能包括施工图纸、工程变更通知、会议纪要、来往函件、现场签证、采购发票以及市场价格信息等。及时发现并书面通知对方漏项情况，并同时收集相关证据，这将为后续的协商或争议解决提供有力的支持。

四、其他注意事项

1. 明确漏项具体情况：在处理之前，我们需要先了解漏项的具体内容、对工程造价的影响以及责任归属等信息，这将为后续的处理奠定基础。
2. 加强沟通与合同管理：为了提高工程量清单的编制质量，明确合同中的权利与义务，并建立有效的沟通机制，我们可以预防类似问题的再次发生。
3. 法律救济途径：如果无法通过协商解决争议，那么我们可以依法向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，处理总价合同中的工程量清单缺项问题需要综合考虑合同约定、法律法规、公平合理原则以及实际情况等多个方面。通过协商、鉴定或法律途径来寻求解决方案，并注重证据的收集与管理，将有助于我们维护自身的合法权益。同时，加强合同管理和提高清单编制质量也是预防此类问题的关键所在。