结论：抵押按揭车协议抵账后，是否还会被法院执行，取决于多个因素，包括协议的效力、是否办理了抵押登记、以及是否存在其他债权人等。以下从不同角度进行分析：
一、协议效力与抵押登记情况
协议有效且已办理抵押登记：
- 如果抵押按揭车协议是双方真实意思表示，且内容合法，同时已经按照法律规定办理了抵押登记，那么该抵押权是有效的。
- 在这种情况下，如果债务人（即车辆的原所有人）未能按照协议履行债务，债权人（即接受抵账的一方）有权依据抵押权向法院申请执行该车辆，以优先受偿。
协议有效但未办理抵押登记：
- 如果协议虽然有效，但未办理抵押登记，根据《民法典》的相关规定，抵押权可能无法对抗善意第三人。
- 这意味着，如果债务人将车辆再次抵押或出售给不知情的第三方，且该第三方已经取得了车辆的所有权或抵押权，那么债权人可能无法直接通过执行该车辆来受偿。但债权人仍可以依据协议向债务人主张债权，要求其履行债务或承担违约责任。
协议无效或存在瑕疵：
- 如果抵押按揭车协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、显失公平等），那么该协议可能无法产生预期的法律效果。
- 在这种情况下，债权人可能无法依据协议向法院申请执行该车辆，而需要通过其他途径（如诉讼、仲裁等）来维护自己的权益。
二、存在其他债权人的情况
- 如果债务人存在多个债权人，且其他债权人也对该车辆主张权利，那么法院在执行时可能会考虑各债权人的债权比例、抵押权的优先顺序等因素来分配执行款。
- 如果债权人的抵押权已经依法登记，且没有其他更优先的债权存在，那么债权人通常有权优先受偿。但如果存在其他更优先的债权（如税收债权、职工工资债权等），或者债权人的抵押权未依法登记，那么其受偿顺序可能会受到影响。
三、法律建议
- 确保协议有效并办理抵押登记：在签订抵押按揭车协议时，应确保协议内容合法、双方意思表示真实，并尽快办理抵押登记手续，以保障自己的抵押权。
- 了解债务人的财务状况和信用情况：在接受抵账前，应对债务人的财务状况和信用情况进行充分了解，以评估其履行债务的能力和风险。
- 及时行使权利：如果发现债务人未能按照协议履行债务，应及时向法院申请执行或采取其他法律措施来维护自己的权益。
举例说明：假设甲将一辆按揭车抵押给乙作为债务担保，并签订了抵押协议且办理了抵押登记。后来甲未能按时还款，乙有权依据抵押权向法院申请执行该车辆。但如果甲在抵押期间又将车辆出售给了不知情的丙，并办理了过户手续，那么乙可能无法直接执行该车辆，而需要通过诉讼等方式来主张自己的权益。
后续思考依据：在处理类似案件时，法院通常会综合考虑协议的效力、抵押登记情况、是否存在其他债权人以及各债权人的债权比例和优先顺序等因素来作出判决或裁定。因此，在签订抵押按揭车协议时，应充分考虑这些因素并采取相应的法律措施来保障自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。