两家公司互欠款的情况下，付款不可以差额处理。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第五百六十八条的规定：“当事人互负债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定不得抵销的除外。当事人主张抵销的，应当通知对方。通知自到达对方时生效。抵销不得附条件或者附期限。”

这意味着，在两家公司互欠款项的情况下，如果双方债务的种类和品质相同，且不存在不得抵销的情形，那么双方可以协商进行债务抵销。但抵销必须基于双方债务的全额，而不能是差额。

二. 差额付款的风险

1. 账务不清：如果采用差额付款的方式，可能会导致双方账务不清，难以准确核对债务余额，进而引发纠纷。
2. 法律风险：差额付款可能被视为部分履行债务，而非债务抵销。在对方不承认差额付款为债务抵销的情况下，付款方可能仍面临被追讨剩余债务的风险。

三. 建议的处理方式

1. 明确欠款情况：双方应首先明确各自的欠款事实和具体金额，确保对债务有清晰的认识。
2. 协商债务抵销：在明确欠款情况的基础上，双方可以协商进行债务抵销。如果双方债务可以全额抵销，则应按照全额进行抵销；如果无法全额抵销，双方可以就剩余债务进行进一步协商或采取其他法律途径解决。
3. 签订书面协议：为了避免日后纠纷，双方应就债务抵销事宜签订书面协议，明确抵销的金额、时间、方式等关键条款。

• 例如，两家公司A和B互有欠款，A公司欠B公司100万元，B公司欠A公司80万元。在这种情况下，双方可以协商将80万元的债务进行抵销，剩余20万元的债务由欠款方继续履行。但这一过程必须明确、合法，并最好通过书面协议加以固定。

我的观点是，两家公司互欠款的情况下，付款不可以差额处理。双方应明确欠款情况，协商进行债务抵销，并签订书面协议以确保合法性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。