关于路政在服务区查车是否合法的问题，这主要取决于具体的法律法规以及查车的具体情形。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在高速公路上直接拦截检查行驶的车辆，一般是不被允许的。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第六十九条的规定，任何单位、个人不得在高速公路上拦截检查行驶的车辆，但公安机关的人民警察依法执行紧急公务除外。这一规定主要是为了保障高速公路的畅通和行车安全。
然而，在服务区设置执勤点进行查车，则是被允许的。根据《交通警察执勤执法工作规范》第三十六条的规定，在高速公路上执勤时，交警应当以巡逻为主，但必要时可以在收费站、服务区设置执勤点。这意味着，在服务区进行查车，是交警依法执行职务的一种方式，是合法的。
此外，还有一些地方性的法规也对此进行了明确。例如，《山东省高速公路交通安全条例》第三十条规定，公安机关交通管理部门可以在高速公路出入口、服务区、检查站对涉嫌超载、超速、故意遮挡号牌、伪造变造号牌、酒后驾驶等严重交通违法行为进行检查。这进一步说明了在服务区进行查车的合法性。
总结来说：
因此，如果您在服务区遇到路政或交警进行查车，只要他们的行为符合法律法规和执法规范，那么这种查车行为就是合法的。如果您对查车行为有疑问或不满，可以向相关部门进行咨询或投诉。