检察院对公职人员贪污四十余万元的处理，通常包括立案侦查、审查起诉，并依法向法院提起公诉，最终由法院根据具体情节判处刑罚。具体分析如下：

1. 立案侦查阶段：

   • 检察院在接到举报、控告或自行发现公职人员存在贪污行为，且数额达到四十余万元（远超贪污罪的立案标准，即三万元以上）时，会依法进行立案侦查。
   • 侦查过程中，检察院会收集、固定证据，包括书证、物证、证人证言、被告人供述等，以证明贪污行为的存在及数额。

2. 审查起诉阶段：

   • 侦查终结后，检察院会对案件进行审查，确认证据是否确实、充分，犯罪事实是否清楚，犯罪性质和罪名的认定是否正确。
   • 若认为案件符合起诉条件，检察院会制作起诉书，向法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送法院。

3. 法院审判阶段：

   • 法院在受理检察院的起诉后，会依法进行审理，包括开庭、法庭调查、法庭辩论、被告人最后陈述等环节。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第三百八十三条的规定，贪污数额较大（一般指三万元以上不满二十万元）或者有其他较重情节的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；贪污数额巨大（一般指二十万元以上不满三百万元）或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产。四十余万元的贪污数额已属于“数额巨大”范畴，因此，法院可能会判处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产。
   • 法院在判决时，还会考虑被告人的认罪态度、悔罪表现、退赃情况等因素，对量刑进行适当调整。

4. 其他可能后果：

   • 除了刑事处罚外，公职人员还可能面临党纪政务处分，如开除党籍、开除公职等。
   • 若贪污行为给国家或集体造成损失，检察院或法院还可能依法追缴赃款赃物，或责令被告人进行赔偿。

总结来说，公职人员贪污四十余万元，将面临检察院的立案侦查、审查起诉，并最终由法院根据具体情节判处刑罚。同时，还可能面临党纪政务处分及财产追缴等后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。