针对您入职前厂里指定医院体检后不给办理入职，称体检不合格的情况，我们可以从以下几个方面来分析和处理：
首先，您需要明确的是，用人单位确实有权基于求职者的健康状况来设置录取条件，但这种权利并非没有边界。根据《中华人民共和国就业促进法》第三十条的规定，除了经医学鉴定传染病病原携带者在治愈前或者排除传染嫌疑前，不得从事法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使传染病扩散的工作外，其他非法定从业健康限制的情况下，用人单位不得擅自做出不合理的差别对待、排斥或限制行为。
接下来，您需要核实体检不合格的具体原因。如果体检结果显示的是一些并不影响劳动能力的异常，如脂肪肝、高血糖、转氨酶偏高等，而这些异常并不构成法律规定的从业健康限制，那么用人单位以此为由拒绝录用您，就可能涉嫌就业歧视。
在这种情况下，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与用人单位沟通：首先，您可以尝试与用人单位进行沟通，了解他们拒绝录用的具体原因，并询问是否有其他岗位或工作安排可以考虑。如果用人单位能够给出合理的解释，并且您也愿意接受其他岗位或工作安排，那么问题可能得到妥善解决。
收集证据：如果用人单位拒绝沟通或给出的理由不合理，您需要开始收集证据，包括体检报告、与用人单位的沟通记录等，以证明您并未因体检不合格而影响劳动能力，且用人单位的行为可能构成就业歧视。
寻求法律援助：在收集到足够证据后，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的合法权益。如果法院审理认为用人单位的行为确实违反了法律规定，您可能会获得相应的赔偿和道歉。
关注典型案例：同时，您也可以关注一些类似的典型案例，了解法院在处理此类纠纷时的态度和原则，这有助于您更好地理解自己的权益和可能的维权途径。
总之，面对用人单位以体检不合格为由拒绝录用的情况，您需要保持冷静，核实原因，收集证据，并寻求法律援助来维护自己的合法权益。同时，也希望用人单位能够尊重劳动者的平等就业权，避免滥用体检不合格作为拒绝录用的理由。