针对“借据不同但原告同一、被告同一的情况如何处理”这一问题，核心结论需分情况讨论，具体如下：

1. 若多份借据涉及同一法律关系（如同一笔借款分多次出具借据）
   需重点审查借据之间的关联性。若证据显示多份借据实际为同一笔债务的分期确认（如借款本金未归还，仅更换借据或补充利息条款），法院可能合并审理，并要求原告明确诉讼标的总额。此时需注意：

   • 借据中约定的利率、违约金等条款若存在冲突，以最后一份有效借据为准；
     
   • 若原告重复主张同一笔债务，法院可能驳回重复部分诉求，避免“一事二诉”。

2. 若多份借据涉及不同法律关系（如多笔独立借款）
   原告可合并起诉或分案起诉，但需满足以下条件：

   • 合并起诉：需证明多笔借款存在关联性（如基于同一合同、同一用途或被告承诺统一偿还），否则法院可能要求分案处理；
     
   • 分案起诉：若每笔借款的金额、期限、担保方式等独立，原告可分别提起诉讼，法院将独立审理并判决。此时需注意诉讼时效问题，避免部分债权因超期丧失胜诉权。

3. 若借据存在瑕疵（如签名伪造、内容篡改）
   被告可提出抗辩或申请司法鉴定。例如：

   • 若被告否认借据真实性，法院将委托鉴定机构对签名、手印、形成时间等进行鉴定；
     
   • 若鉴定显示借据被篡改（如金额被修改），法院可能否定该借据效力，甚至对伪造证据方予以司法处罚。

4. 若原告主体资格存疑（如借据持有人非出借人）
   需审查债权转让是否合法。例如：

   • 若原告通过债权转让取得债权，需提供转让协议、通知被告的证据等；
     
   • 若无法证明债权转让合法性，法院可能驳回原告起诉，要求实际出借人主张权利。

实务建议：

• 对原告而言，需整理所有借据的原件及转账记录、聊天记录等辅助证据，形成完整证据链；
  
• 对被告而言，应重点审查借据真实性、关联性及履行情况，必要时申请鉴定或提交还款凭证；
  
• 双方均可申请法院调查取证（如调取银行流水、监控录像等），以查明资金流向及借据形成过程。

如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。