结论：村委以清查核资为由收回养鸡厂土地，且未召开村委会就将养鸡厂告上法院，这一行为是否违规，需结合具体情况来判断，但未召开村委会会议直接起诉，在程序上可能存在瑕疵。以下从多个角度进行分析：
一、村委收回土地的合法性
土地使用权归属：
- 首先，需要明确养鸡厂所占土地的使用权归属。如果养鸡厂是通过合法途径（如承包、租赁等）从村委或集体获得土地使用权，那么村委在未经合法程序的情况下，不能随意收回土地。
- 如果养鸡厂存在违法用地、闲置土地或违反合同约定等情况，村委可能依据相关法律法规或合同条款收回土地。但即便如此，也应遵循法定程序，如提前通知、协商、听证等。
清查核资的合法性：
- 清查核资本身是一种管理手段，用于核实资产、清理债务等。但村委不能仅凭清查核资就单方面决定收回土地，除非有明确的法律法规或合同依据。
- 如果清查核资过程中发现养鸡厂存在违法或违规行为，村委应依法依规进行处理，而不是直接收回土地。
二、未召开村委会会议直接起诉的合法性
村委会会议的决策作用：
- 村委会是村民自我管理、自我教育、自我服务的基层群众性自治组织，其决策应遵循民主集中制原则，通过召开村委会会议来讨论和决定重要事项。
- 收回土地、起诉等涉及村民重大利益的事项，理应经过村委会会议讨论并形成决议。
直接起诉的程序瑕疵：
- 如果村委未召开村委会会议就直接将养鸡厂告上法院，这一行为在程序上可能存在瑕疵。因为村委会作为集体经济组织的管理者，其决策应体现集体意志，而非个人或少数人的意志。
- 即便村委认为养鸡厂存在违法或违规行为，也应先通过合法程序（如召开村委会会议、发出整改通知等）进行处理，如果养鸡厂拒不整改或无法达成一致意见，再考虑通过法律途径解决。
三、法律建议
对于养鸡厂：
- 如果认为村委的行为违法或违规，可以收集相关证据（如土地使用权证明、合同、村委会会议记录等），向相关部门（如乡镇政府、土地管理部门等）投诉或举报。
- 如果村委已经提起诉讼，养鸡厂应积极应诉，提供证据证明自己的合法权益，并请求法院依法判决。
对于村委：
- 应严格遵守法律法规和村规民约，依法依规处理土地纠纷和集体事务。
- 在涉及村民重大利益的事项上，应充分发扬民主，通过召开村委会会议等方式广泛听取村民意见，确保决策的合法性和合理性。
后续思考：在实际操作中，土地纠纷和集体事务的处理往往涉及复杂的法律关系和利益博弈。因此，建议双方在处理此类问题时保持冷静和理性，通过协商、调解等和平方式解决争议。如果无法达成一致意见，再考虑通过法律途径解决。同时，也可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。如果你有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。