建设工程施工合同关系的认定是一个综合考量多方面因素的过程，以下是从不同角度对建设工程施工合同关系认定的详细分析：
合同形式与成立
- 书面形式：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，建设工程合同应当采用书面形式。这是为了确保合同条款的明确性和可执行性，减少因合同条款不清而产生的纠纷。若未采用书面形式，但一方已经履行了主要义务，且对方接受的，法院也可能认定合同关系成立。
- 合同成立时间：合同一般于双方当事人签字或盖章时成立。对于特殊项目，如招投标项目，中标通知书发出时合同即告成立。
主体资格
- 发包方资格：发包方需具备民事行为能力和权利能力，如房地产开发企业需具备合法的开发资质。这是确保发包方能够履行合同义务，承担合同责任的基础。
- 承包方资格：承包方必须是具有相应资质等级的建筑施工企业，并需持有安全生产许可证等证照。这是保证承包方具备完成工程建设任务的能力和条件。
实际履行行为
- 施工行为：承包方按照合同约定或发包方的指示进行施工，施工日志、监理记录等可以作为证明施工行为的证据。这些证据能够证明承包方已经按照合同约定履行了施工义务。
- 支付行为：发包方按照约定支付工程款，银行转账记录、收款收据等可以作为支付凭证。这些证据能够证明发包方已经按照合同约定履行了支付义务。
其他相关证据
- 招投标文件：招投标文件是认定合同关系的重要基础，对确定双方权利义务具有重要意义。它们能够证明双方在合同签订前的协商过程和达成的共识。
- 往来函件、会议纪要：这些文件反映了双方沟通协商的过程，有助于证明合同关系的存在及履行情况。它们能够补充书面合同中的不足，提供更全面的合同履行证据。
建设工程施工合同与其他合同的区分
- 与劳务合同的区分：建设工程合同交付的是质量合格的建设工程，而劳务合同提供的是劳务。支付对价条件也不同，建设工程合同需物化劳动成果后支付，而劳务合同提供劳务后即可请求支付。
- 与承揽合同的区分：虽然建设工程合同属于特殊类型的承揽合同，但两者在解除权限制上存在差异。建设工程合同不能任意解除，因其影响大、价值高，涉及公共利益。
特殊情形下的合同关系认定
- 挂靠经营：在挂靠经营中，被挂靠单位与实际施工单位之间往往没有直接的合同关系。但根据相关法律法规和司法实践，被挂靠单位仍需对工程质量承担连带责任。认定时需注意区分内部承包与外部挂靠的区别。
- 转包与违法分包：转包和违法分包均属于违法行为，不受法律保护。但在实际纠纷中，仍需根据具体情况认定合同关系的存在与否及责任承担方式。例如，在转包情况下，承包人仍需就已完成工程的质量向发包人承担责任；在违法分包情况下，总承包单位与分包单位需就分包工程的质量承担连带责任。
- “黑白合同”：“黑白合同”是指当事人就同一建设工程签订的两份或两份以上实质性内容相异的合同。认定时应以经过备案的中标合同（即“白合同”）为准，除非有证据证明“白合同”并非双方真实意思表示或存在其他导致合同无效的情形。
在认定建设工程施工合同关系时，应综合考虑合同形式与成立、主体资格、实际履行行为、其他相关证据以及与其他合同的区分等多个方面。如果在实际操作中遇到复杂情况或难以认定的问题，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。