当警察违反程序合法性时，会根据违法情节的严重程度、造成的后果以及相关法律规定，面临内部纪律处分、行政处罚、刑事追责或程序性法律后果等不同处理方式。具体如下：

1. 内部纪律处分
   若警察违反程序合法性但情节轻微，未造成严重后果，公安机关内部会依据《公安机关人民警察纪律条令》等规定，对涉事警察进行纪律处分。处分类型包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。例如，未按规定出示证件、未告知权利义务等程序瑕疵，可能被给予警告或记过处分。

2. 行政处罚
   若警察的违法行为构成行政违法，但未达到刑事犯罪程度，可能面临行政处罚。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律，警察可能被处以警告、罚款、拘留等处罚。例如，非法限制公民人身自由、非法搜查他人身体等行为，可能被处以行政拘留并罚款。

3. 刑事追责
   若警察的违法行为构成犯罪，如刑讯逼供、暴力取证、滥用职权、玩忽职守等，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》相关规定，涉事警察可能面临有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。例如，刑讯逼供致人伤残、死亡的，可能被判处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑。

4. 程序性法律后果
   若警察违反程序合法性导致证据收集、案件处理等程序违法，可能引发程序性法律后果。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律，违法收集的证据可能被排除，案件可能被撤销、不起诉或宣告无罪。例如，通过刑讯逼供获得的口供，不得作为定案根据，案件可能因证据不足而无法定罪。

建议：若您认为警察在执法过程中存在程序违法问题，可依法向公安机关督察部门投诉，或通过行政复议、行政诉讼等途径维护自身权益。具体操作时，建议收集相关证据，如执法记录仪视频、证人证言等，以支持您的主张。如有进一步疑问，可直接向我咨询。