若汽车登记在他人名下，可通过以下方式保障自身权益：

1. 签订书面协议明确权属
   与车辆登记人签订《代持协议》或《借名购车协议》，明确约定车辆实际所有权归属、使用方式、费用承担、违约责任等条款。协议需符合《民法典》第143条规定的民事法律行为有效要件（行为人具有相应能力、意思表示真实、不违反法律强制性规定）。
   注意：若购车涉及限购政策（如北京、上海），借名购车可能因违反地方性法规导致协议无效，需提前评估政策风险。

2. 保留完整出资证据
   保存购车款支付凭证（银行转账记录需备注“购车款”）、购车发票、保险费缴纳记录、维修保养记录等，形成完整证据链证明实际出资事实。若通过第三方支付，需补充书面说明确认资金用途。

3. 办理抵押登记（如允许）
   若车辆登记人同意，可办理抵押登记将车辆抵押给实际车主，并签订《抵押合同》明确抵押权范围。根据《民法典》第394条，抵押权设立后，未经抵押权人同意，车辆不得转让，可有效防止登记人擅自处分车辆。

4. 控制车辆实际使用
   实际占有、使用车辆并保留相关证据（如停车费发票、ETC记录、违章处理记录等），证明对车辆的实际支配权。若发生权属争议，实际使用状态可作为辅助证据。

5. 提前规划继承/赠与安排
   若涉及家庭内部代持，可通过遗嘱或赠与协议明确车辆归属。例如，登记人可立遗嘱指定实际车主为车辆继承人，或签订《赠与合同》并办理公证，降低后续继承纠纷风险。

风险提示：

• 若登记人因债务被执行，车辆可能被法院查封拍卖，实际车主仅能以债权人身分主张权利，无法对抗强制执行。
  
• 若登记人擅自转让车辆，第三人可能基于《民法典》第224条（动产交付生效）善意取得所有权，实际车主难以追回车辆。
  

建议：

• 优先以自己名义购车，避免代持风险；
  
• 若必须代持，务必签订书面协议并办理抵押登记；
  
• 定期核查车辆登记状态，防止被擅自处分。
  

如有具体场景或协议起草需求，可进一步向我说明细节。