挂靠人与被挂靠人之间的挂靠协议，在法律上通常被认定为无效，法院在处理此类纠纷时，会依据相关法律法规进行裁决。以下是对这一问题的详细分析：
一、挂靠协议的法律性质与无效性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第二十六条，承包建筑工程的单位必须持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。法律明确禁止没有资质的单位或个人借用有资质的建筑施工企业名义承揽工程，也禁止有资质的建筑施工企业以任何形式允许其他单位或个人使用其资质证书、营业执照。
- 《建设工程质量管理条例》第二十五条也对此进行了类似规定，强调施工单位必须依法取得相应等级的资质证书，并在其资质等级许可的范围内承揽工程，禁止施工单位允许其他单位或者个人以本单位的名义承揽工程。
合同效力：
- 由于挂靠行为违反了上述法律法规的强制性规定，因此挂靠人与被挂靠人之间签订的挂靠协议自始无效，不受法律保护。这意味着，双方基于挂靠协议所设定的权利义务关系，在法律上不被认可。
二、法院处理挂靠协议纠纷的原则
合同无效后的处理：
- 当挂靠协议被认定无效后，双方基于该协议取得的财产应当予以返还或折价补偿。有过错的一方应赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，则各自承担相应的责任。
工程款支付问题：
- 在挂靠关系中，如果工程竣工验收合格，且双方有实际履行合同的意愿和行为，法院可能会支持挂靠人要求被挂靠人支付工程价款的请求。但这一支持并非绝对，如果工程未验收合格或存在其他问题，法院则可能不予支持。
连带责任承担：
- 对于因挂靠行为产生的各种问题，如工程质量问题、拖欠工程材料款、劳务费等，挂靠人和被挂靠人往往需要承担连带责任。这一原则在司法实践中得到广泛应用，旨在保护第三方的合法权益，防止挂靠人和被挂靠人通过非法挂靠行为逃避法律责任。
三、挂靠协议无效后的法律后果
行政责任：
- 被挂靠人因允许他人挂靠而可能面临行政处罚，包括罚款、吊销资质证书等。这些行政处罚旨在维护建筑市场的秩序和公平竞争环境。
民事责任：
- 除了上述提到的连带责任外，挂靠人和被挂靠人还可能因各自的过错行为而承担其他民事责任。例如，如果挂靠人因施工质量问题导致第三方受损，被挂靠人作为名义上的施工方，可能需要承担相应的赔偿责任。同时，挂靠人也可能因违反合同约定或擅自从事超越授权范围的活动而向被挂靠人承担违约责任。
刑事责任：
- 在某些情况下，如果挂靠人的行为构成犯罪（如重大责任事故罪、工程重大安全事故罪等），被挂靠人也可能因涉及共同犯罪或提供便利等而被追究刑事责任。这进一步强调了挂靠行为的严重性和法律后果的严厉性。
四、建议与启示
- 遵守法律法规：挂靠人和被挂靠人应严格遵守相关法律法规，避免通过非法挂靠方式开展业务合作。这不仅是维护自身合法权益的需要，也是维护建筑市场秩序和公平竞争环境的责任。
- 合法途径合作：双方应通过合法途径开展业务合作，如通过合法的分包、转包等方式进行工程承包。这些方式在法律上得到认可和支持，能够保障双方的合法权益。
- 风险防范意识：在签订任何合同或协议前，双方应充分了解相关法律法规和政策要求，评估合作风险，并制定相应的风险防范措施。这有助于降低合作过程中的法律风险和经济损失。
综上所述，挂靠人与被挂靠人之间的挂靠协议在法律上通常被认定为无效。法院在处理此类纠纷时，会依据相关法律法规进行裁决，并强调双方应遵守法律法规、通过合法途径开展业务合作。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。