两家独立的公司之间签订的关于认工龄的协议，其有效性取决于协议的具体内容、签订程序以及是否违反法律法规的强制性规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议内容合法性：

   • 不违反法律强制性规定：如果协议内容不违反国家法律法规的强制性规定，比如不涉及欺诈、胁迫、恶意串通损害国家、集体或第三人利益等情形，那么该协议在内容上是合法的。
   • 明确工龄认定方式：协议中应明确工龄的认定方式，包括但不限于工作年限的计算、是否包含间断期、如何处理不同公司间的工龄衔接等。这些内容需要具体、明确，以便在执行过程中有据可依。

2. 签订程序合规性：

   • 双方自愿签订：协议必须是双方自愿签订的，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时受到不正当影响，那么该协议可能因缺乏自愿性而无效。
   • 具备相应民事行为能力：签订协议的双方必须具备相应的民事行为能力，即能够理解协议内容并承担协议约定的义务。如果一方或双方不具备民事行为能力，那么该协议可能因主体不适格而无效。
   • 形式要件：虽然工龄认定协议不一定需要采用特定的形式（如书面形式），但为了确保协议的明确性和可执行性，建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。

3. 可能存在的法律风险：

   • 社保与福利衔接：工龄的认定往往与社保缴纳、福利待遇等密切相关。如果两家公司之间的工龄认定协议未能妥善处理这些问题，可能会导致员工在社保缴纳、福利待遇等方面出现纠纷。
   • 劳动争议：如果协议内容不明确或存在争议，可能会引发劳动争议。例如，员工可能对工龄的认定方式提出异议，或者要求按照更高的标准享受福利待遇等。

4. 建议与措施：

   • 明确协议内容：在签订协议前，双方应充分沟通并明确协议内容，包括工龄的认定方式、社保与福利的衔接等。
   • 咨询专业律师：由于工龄认定协议涉及复杂的法律问题，建议双方在签订协议前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
   • 完善协议条款：在协议中应明确约定争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等，以便在出现争议时能够及时、有效地解决。

如果两家独立的公司之间签订的关于认工龄的协议符合上述条件，即内容合法、签订程序合规，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么该协议是有效的。然而，由于工龄认定协议涉及复杂的法律问题，建议在签订前务必咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。