购房合同上将两个人出首付但仅把女方写成代理人的情况，通常意味着女方被指定为代表双方处理与购房合同相关事务的人。以下是对此问题的详细分析：

一、代理人的法律含义

在法律上，代理人是指根据委托人的授权，代表委托人进行民事法律行为的人。在购房合同中，如果女方被写成代理人，那么她有权代表双方（即出首付的两个人）与卖方进行沟通、签署文件、办理相关手续等。但需要注意的是，代理人的权限通常限于合同明确授权的范围，除非有特别约定，否则代理人无权擅自改变合同内容或做出对委托人不利的决定。

二、可能的原因和意图

1. 方便办理手续：将一方写成代理人可能是为了简化手续办理流程，避免双方都需要亲自到场签署文件或办理相关手续。
2. 信任关系：双方可能基于信任关系，选择一方作为代理人来处理购房事宜。
3. 法律或政策要求：在某些情况下，法律或政策可能要求购房合同中必须指定一个代理人来处理特定事务。

三、需要注意的法律问题

1. 代理权限的明确性：购房合同中应明确代理人的权限范围，以避免因权限不清而产生的纠纷。如果代理人的行为超出了合同授权的范围，那么这些行为可能不被法律认可，甚至可能给委托人带来损失。
2. 共同所有权的确认：虽然女方被写成代理人，但购房合同上的房产通常是双方共同所有的。因此，在处理房产相关事宜时，应确保双方的权益都得到保障。例如，在办理房产证时，应明确双方为共同共有人或按份共有人，并注明各自的份额。
3. 合同条款的审查：在签署购房合同前，双方应仔细审查合同条款，特别是关于代理人的部分。确保合同条款符合双方的意愿和利益，避免因合同条款不清或存在歧义而产生的纠纷。

四、建议

1. 明确代理权限：如果双方决定将一方写成代理人，建议在购房合同中明确代理人的权限范围，并附上相关的授权文件。
2. 共同参与决策：尽管有一方作为代理人，但双方仍应共同参与购房决策过程，确保双方的意愿和利益都得到充分考虑。
3. 咨询专业律师：在处理购房合同等法律事务时，建议咨询专业律师的意见。律师可以提供专业的法律建议，帮助双方避免潜在的法律风险。

如果有任何关于购房合同或房产问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议。