结论是：收款凭证上未写大写金额，一般情况下不影响债权债务已结清的法律效力，但为避免潜在纠纷，建议采取补救措施。

一、从法律效力角度分析

在民间借贷或一般债务清偿场景中，双方达成债权债务结清的合意，并实际履行了付款义务（如您已收款1000元），即构成法律上的债务清偿。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务人履行债务后，债权债务关系即告终止。此时，收款凭证（如收条、转账记录等）的主要作用是证明债务已清偿的事实，而非必须严格符合财务规范。

未写大写金额，通常不会影响收款凭证的法律效力。因为：

1. 核心事实清晰：双方对“收款1000元”无争议，且实际履行了付款义务。
2. 形式瑕疵不否定实质效力：法律未强制要求收款凭证必须使用大写金额，只要能证明债务已清偿即可。

二、从风险防范角度分析

尽管法律上可能无影响，但未写大写金额可能存在以下潜在风险：

1. 金额篡改风险：若收款凭证为手写且未写大写，可能存在被篡改金额的风险（如将“1000”改为“10000”）。
2. 举证困难风险：若未来发生纠纷（如对方主张未付款或付款金额不符），未写大写的凭证可能因形式瑕疵导致举证困难。

三、建议采取的补救措施

为避免潜在纠纷，建议采取以下补救措施：

1. 补充书面确认：与对方协商，补充一份书面确认文件，明确“双方债权债务已结清，收款金额为1000元（大写：壹仟元整）”。
2. 保留其他证据：如转账记录、聊天记录等，证明债务已清偿的事实。
3. 规范未来凭证：今后在签订收款凭证时，务必同时使用大写和小写金额，并加盖手印或签字确认，以增强证据效力。

四、特殊情况说明

若存在以下特殊情况，未写大写金额可能影响法律效力：

1. 对方主张未付款：若对方否认付款事实，且您无法提供其他证据（如转账记录），未写大写的收款凭证可能因形式瑕疵导致法院不予采信。
2. 金额存在争议：若双方对付款金额存在争议（如对方主张付款为2000元），未写大写的凭证可能无法准确证明实际付款金额。

总结：未写大写金额的收款凭证，在双方无争议且实际履行的情况下，通常不影响债权债务已结清的法律效力。但为避免潜在纠纷，建议采取补救措施，规范未来凭证的书写。如有进一步疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询。