结论：信用卡签订了代扣协议后，即使协商了还本，已扣的钱能否退回需视具体情况而定，包括协商内容、代扣协议条款以及银行的具体操作等。

分析：

1. 协商内容的影响：

   • 如果您与银行或相关机构协商还本时，明确约定了代扣款项的处理方式，比如部分或全部退回，那么根据协商结果，您有权要求退回相应款项。
   • 如果协商内容并未明确提及代扣款项的退回问题，那么退回的可能性就相对较小，因为银行或相关机构可能按照原有协议执行代扣。

2. 代扣协议条款的约束：

   • 代扣协议是您与银行或相关机构之间签订的具有法律效力的文件。如果协议中明确规定了代扣款项的用途、金额、时间以及退回条件等，那么双方都应按照协议执行。
   • 如果协议中并未规定退回条件，或者规定较为模糊，那么您可能需要与银行或相关机构进一步协商，或者寻求法律途径解决。

3. 银行的具体操作：

   • 银行在处理代扣业务时，通常会遵循一定的操作流程和规定。如果银行在代扣过程中存在违规操作或错误，导致您被多扣了款项，那么您有权要求银行退回多扣的部分。
   • 如果银行的操作符合协议规定和法律法规，那么您可能难以要求银行退回已扣的款项。

建议：

• 查看协商记录和代扣协议：首先，您应仔细查看与银行或相关机构的协商记录和代扣协议，明确双方的权利和义务。
• 与银行沟通：如果协商记录和代扣协议中并未明确提及退回问题，或者您认为银行的操作存在违规或错误，那么您可以与银行进行沟通，寻求解决方案。
• 寻求法律途径：如果沟通无果，或者您认为自己的权益受到了侵害，那么您可以考虑寻求法律途径解决，比如向消费者权益保护机构投诉、提起民事诉讼等。

可能后果：

• 如果您能够证明银行或相关机构存在违规操作或错误，并且按照协商结果和代扣协议有权要求退回款项，那么您有可能成功追回已扣的款项。
• 如果您无法提供充分证据证明自己的权益受到了侵害，或者协商结果和代扣协议中并未规定退回条件，那么您可能难以追回已扣的款项。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。