法拍厂房的被告能参与拍卖。但需要注意的是，法院如果因案件需要，有权随时冻结参与拍卖的保证金。若被告隐瞒个人财产参与竞拍，将违背执行程序的财产报告制度，并可能受到法律处罚。同时，被告通过拍卖所得的财产，应当用于偿还债务，法院会对此进行关注，并可能将被执行人所得的财产进行强制执行。
以下是具体的法律依据和解释：
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中拍卖、变卖财产的规定》第十条，拍卖不动产、其他财产权或者价值较高的动产的，竞买人应当于拍卖前向人民法院预交保证金。申请执行人参加竞买的，可以不预交保证金。保证金的数额由人民法院确定，但不得低于评估价或者市价的百分之五。
参与拍卖的注意事项：
- 被告作为竞买人，需要按照法律规定预交保证金。
- 若被告隐瞒个人财产竞拍，将违背执行程序的财产报告制度，并可能面临法律处罚。
- 拍卖成交后，买受人预交的保证金将充抵价款；若拍卖未成交，保证金将在三日内退还竞买人。
拍卖所得财产的处理：
- 被告通过拍卖所得的财产，应当用于偿还债务。
- 法院会关注被告的拍卖所得，并可能根据案件需要，对被告所得的财产进行强制执行。
综上所述，法拍厂房的被告可以参与拍卖，但需要遵守相关法律规定，并承担可能面临的法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。