在运输合同纠纷中，是否可以主张误工费赔偿，需视具体情况而定。
合同约定或法律规定的情况：
- 若运输合同中明确约定了因违约导致的误工费赔偿条款，或者根据相关法律规定，违约方应赔偿因违约行为给对方造成的合理误工损失，且该损失与违约行为存在直接的因果关系，那么受损方有权主张误工费赔偿。
无明确约定或法律规定的情况：
- 若运输合同中未对误工费赔偿作出明确约定，且根据现有法律规定也难以认定违约方应承担误工损失，那么受损方通常难以直接主张误工费赔偿。
法律建议：
- 在签订运输合同时，建议双方明确约定违约赔偿条款，包括误工费、交通费等可能产生的损失，以便在发生纠纷时有明确的法律依据。
- 若发生运输合同纠纷，且涉及误工费赔偿问题，受损方应收集相关证据（如误工证明、收入证明等），以证明误工事实及损失的具体金额。
- 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师，以便更准确地理解法律规定，评估自身权益，并制定合适的诉讼策略。
综上所述，运输合同纠纷中的误工费赔偿问题需根据具体情况来判断，包括合同约定、法律规定以及损失与违约行为的因果关系等因素。