逾期协查函通常由债权人或者其委托的第三方机构（如律师事务所、催收公司等）发出。以下是对这一问题的详细分析：

1. 债权人直接发出：

   • 在合同纠纷中，如果一方（债权人）未按照合同约定的时间收到应得的款项或履行其他义务，且另一方（债务人）存在逾期行为，债权人为了维护自身权益，可能会直接向债务人发出逾期协查函。
   • 这种函件通常包含对逾期事实的陈述、要求债务人立即履行义务或提供合理解释的内容，以及可能采取的法律措施等。

2. 债权人委托第三方机构发出：

   • 在某些情况下，债权人可能选择委托律师事务所、催收公司等第三方机构来发出逾期协查函。
   • 第三方机构通常具有更专业的法律知识和催收经验，能够更有效地与债务人沟通，并促使债务人履行义务。
   • 委托第三方机构发出函件时，债权人需要确保该机构具有合法的资质和授权，以避免因函件发出不当而引发的法律风险。

法律背景与建议：

• 逾期协查函的发出应当基于合法、合理的依据，且内容应当真实、准确。函件中不得包含威胁、恐吓等违法内容。
• 对于债务人而言，收到逾期协查函后应当认真对待，及时与债权人或第三方机构沟通，了解逾期原因并尽快履行义务或提供合理解释。
• 如果债务人对函件内容有异议或认为债权人的要求不合理，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自身合法权益。

可能的法律后果：

• 如果债务人收到逾期协查函后仍未履行义务或提供合理解释，债权人可能会采取进一步的法律措施，如提起诉讼、申请强制执行等。
• 在这些法律程序中，债务人可能需要承担违约责任、支付逾期利息或罚款等法律后果。

因此，逾期协查函的发出主体主要是债权人或其委托的第三方机构。在处理此类函件时，建议双方保持冷静、理性，通过合法途径解决纠纷。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。