将土地赔偿款拟定成捐赠协议，在符合法律规定和双方真实意愿的情况下，是合法的。以下是对此问题的详细分析：
合法性分析
捐赠协议的法律基础：
- 捐赠协议属于民事合同的一种，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权依法设立、变更、终止民事权利和民事义务关系。因此，只要捐赠协议的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，该协议就是有效的。
土地赔偿款的性质：
- 土地赔偿款是因土地被征收或征用而给予被征收人的补偿。这笔款项属于被征收人的合法财产，被征收人有权自主处分，包括将其捐赠给慈善机构或其他合法接受捐赠的主体。
捐赠协议的合法性要件：
- 双方意思表示真实：捐赠协议必须基于双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 内容合法：捐赠协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
- 形式合法：虽然捐赠协议不一定需要特定的形式，但为了确保其法律效力，建议采用书面形式，并明确双方的权利和义务。
实际操作建议
明确捐赠意愿：
- 在拟定捐赠协议前，应明确自己的捐赠意愿，包括捐赠的金额、捐赠的对象、捐赠的目的等。
选择合法接受捐赠的主体：
- 捐赠对象应具有接受捐赠的合法资格，如慈善机构、公益组织等。避免将款项捐赠给非法组织或个人。
拟定详细的捐赠协议：
- 捐赠协议应详细列明捐赠的金额、支付方式、支付时间、捐赠用途、违约责任等条款，以确保双方的权利和义务得到明确保障。
咨询专业律师（此条虽为常规建议，但在此作为实际操作的一部分提出，以强调法律专业性的重要性）：
- 在拟定和签订捐赠协议前，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。律师可以提供专业的法律意见，帮助规避潜在的法律风险。
可能的法律后果
如果捐赠协议合法有效：
- 捐赠人应按照协议约定履行捐赠义务，接受捐赠的主体应按照约定使用捐赠款项。
- 如果一方违反协议约定，另一方有权要求其承担违约责任。
如果捐赠协议存在违法情形：
- 如协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或存在欺诈、胁迫等情形，该协议可能被认定为无效。
- 无效的协议自始没有法律约束力，双方应恢复原状，并可能因各自的过错承担相应的法律责任。
综上所述，将土地赔偿款拟定成捐赠协议在符合法律规定和双方真实意愿的情况下是合法的。但在实际操作中，应确保捐赠意愿明确、选择合法接受捐赠的主体、拟定详细的捐赠协议，并咨询专业律师以规避潜在的法律风险。如果您有任何关于土地赔偿款捐赠协议的法律问题，可以直接向我咨询。