对证据合法性进行审查的机构主要包括公安机关、人民检察院和人民法院。以下是对这一问题的详细分析：

1. 公安机关：

   • 在刑事诉讼中，公安机关负责侦查活动，包括收集、固定和审查证据。公安机关在侦查过程中，需要对证据的合法性进行初步审查，确保所收集的证据符合法律规定，不侵犯犯罪嫌疑人的合法权益。例如，公安机关在讯问犯罪嫌疑人时，必须遵守法定程序，如出示工作证件、告知权利义务等，以确保讯问过程的合法性，从而保证所获取的口供等证据的合法性。

2. 人民检察院：

   • 人民检察院作为法律监督机关，在刑事诉讼中承担着对证据合法性的审查职责。人民检察院在审查起诉阶段，会对公安机关移送的证据进行全面审查，包括证据的合法性、真实性和关联性。如果人民检察院发现证据存在非法收集的情况，如刑讯逼供、非法搜查等，会依法排除非法证据，确保案件的公正处理。例如，在审查一起盗窃案件时，人民检察院发现公安机关在收集证据时存在违法行为，如未出示搜查证即进行搜查，那么人民检察院会依法排除该非法证据，并可能要求公安机关重新收集证据。

3. 人民法院：

   • 人民法院在审判过程中，同样需要对证据的合法性进行审查。人民法院在庭审阶段，会组织控辩双方对证据进行质证和辩论，以确定证据的合法性和证明力。如果人民法院认为证据存在非法收集的情况，会依法排除该证据，并可能根据案件情况作出相应的判决。例如，在审理一起故意伤害案件时，人民法院发现被告人供述是在刑讯逼供的情况下取得的，那么人民法院会依法排除该供述，并根据其他合法证据作出判决。

法律背景与建议：

• 法律背景：证据的合法性是刑事诉讼中的重要原则之一，它要求证据的收集、固定和审查必须符合法律规定，不得侵犯犯罪嫌疑人的合法权益。这一原则体现了法治精神和对人权的尊重，是确保案件公正处理的基础。
• 法律建议：如果您在刑事诉讼中遇到证据合法性方面的问题，如认为证据存在非法收集的情况，可以向公安机关、人民检察院或人民法院提出异议，并要求依法排除非法证据。同时，您也可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。

综上所述，对证据合法性进行审查的机构主要包括公安机关、人民检察院和人民法院。这些机构在刑事诉讼中各自承担着不同的职责，共同确保证据的合法性和案件的公正处理。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。