合同中关于商业保函的约定，需根据具体交易场景和双方需求来设计条款，核心要点包括保函类型、金额、期限、开具条件、索赔程序及争议解决方式等。以下从实务角度，分情况说明如何撰写相关条款：

1. 保函类型与目的明确

• 投标保函：若用于招投标场景，需约定“乙方应于投标截止日前，向甲方提交由XX银行出具的投标保函，金额为合同总价的X%，有效期至中标通知书发出后XX日。若乙方中标后拒绝签约，甲方有权凭保函索赔。”
• 履约保函：针对合同履行风险，可约定“乙方应于合同签订后XX日内，向甲方提交履约保函，金额为合同总价的X%，有效期至项目验收合格后XX日。若乙方违约，甲方有权按保函条款索赔。”
• 预付款保函：若甲方支付预付款，需约定“乙方应于收到预付款前，向甲方提交预付款保函，金额与预付款一致，有效期至乙方返还预付款或抵扣货款完毕。若乙方未按约使用预付款，甲方有权索赔。”

2. 保函开具条件与形式

• 开具主体：明确保函需由“乙方指定银行（需为甲方认可的银行）”出具，避免非银行机构或信用不足的银行。
• 保函格式：可约定“保函应采用甲方提供的标准格式，或经甲方书面认可的其他格式，并包含不可撤销、见索即付等条款。”
• 语言与法律适用：若涉及跨境交易，需约定“保函应以中文和英文（或合同约定语言）出具，适用法律为中华人民共和国法律。”

3. 保函金额与调整机制

• 固定金额：直接约定“保函金额为人民币XX万元”，适用于金额明确的场景。
• 动态调整：若合同金额可能变动，可约定“保函金额随合同总价调整而同比例增减，乙方应在调整后XX日内提交补充保函。”

4. 保函期限与续期

• 固定期限：约定“保函有效期至XX年XX月XX日”，适用于期限明确的场景。
• 自动续期：若项目周期较长，可约定“保函有效期届满前XX日，乙方应提交续期保函，否则甲方有权暂停支付合同款项直至保函续期完成。”

5. 索赔程序与条件

• 索赔通知：约定“甲方索赔时，应向乙方及保函开具银行同时发出书面索赔通知，说明索赔理由及金额。”
• 索赔材料：明确“甲方需提交保函原件、违约证明文件（如验收不合格报告、违约通知等）作为索赔依据。”
• 索赔时限：可约定“甲方应在保函有效期内提出索赔，逾期视为放弃权利。”

6. 保函返还与注销

• 返还条件：约定“保函有效期届满或合同履行完毕后，甲方应在XX日内将保函原件返还乙方或协助办理注销手续。”
• 未返还责任：若甲方未按时返还，可约定“乙方有权要求甲方按保函金额的X%/日支付违约金，直至保函返还或注销。”

7. 争议解决与法律适用

• 争议解决方式：可约定“因保函产生的争议，双方应协商解决；协商不成的，提交XX仲裁委员会仲裁/向甲方所在地人民法院起诉。”
• 法律适用：明确“保函及本合同适用中华人民共和国法律。”

示例条款（履约保函）：

“乙方应于合同签订后10日内，向甲方提交由甲方认可的银行出具的履约保函，金额为合同总价的10%，有效期至项目验收合格后30日。保函格式应采用甲方提供的标准格式，并包含不可撤销、见索即付条款。若乙方违约，甲方有权凭保函及违约证明文件向银行索赔，索赔金额以保函金额为限。保函有效期届满或合同履行完毕后，甲方应在5日内返还保函原件或协助办理注销手续。”

如有具体交易场景或需求，可进一步细化条款内容，确保保函约定符合双方利益及法律要求。