工程延期申请中存在重叠时间时，一般不能累计算时间。以下从不同角度为您详细分析：

法律原则与合同约定角度

在建设工程领域，工程延期的时间计算通常遵循合同约定以及相关法律法规的规定。合同中往往会明确工程延期的条件、程序以及时间计算方式。如果合同中明确规定了延期时间不能重叠累加，或者规定了延期时间的计算应遵循某种特定方式（如按最长延期时间计算），那么应当遵循合同约定。

从法律原则来看，工程延期时间的计算应当遵循公平、合理、诚实信用的原则。如果允许延期时间重叠累加，可能会导致不公平的结果，比如承包方可能通过故意或过失地制造多个延期事件来获取不合理的延期时间，从而损害发包方的利益。

实际操作与案例分析角度

在实际操作中，工程延期申请往往需要提交详细的延期理由、证据以及延期时间的计算依据。如果延期申请中存在重叠时间，监理方或发包方在审核时通常会要求承包方进行说明和调整，以确保延期时间的合理性和准确性。

案例分析：假设一个工程项目中，由于天气原因导致工程延期5天，同时由于材料供应问题又导致工程延期3天，且这两个延期事件的时间段有重叠（比如都影响了同一周的施工进度）。在这种情况下，如果合同中没有特别规定，监理方或发包方通常会认为这两个延期事件对工程进度的影响是同时发生的，因此不会将延期时间累加计算，而是可能会根据实际情况（如哪个延期事件对工程进度的影响更大）来确定最终的延期时间。

法律建议与风险防范角度

1. 明确合同条款：在签订建设工程合同时，双方应当明确工程延期的条件、程序以及时间计算方式，避免出现模糊或歧义的条款。
2. 及时沟通与协商：在工程延期事件发生时，承包方应当及时与发包方和监理方进行沟通，说明延期原因和预计的延期时间，并协商确定合理的延期方案。
3. 保留证据：承包方在申请工程延期时，应当保留充分的证据来支持其延期申请，如天气报告、材料供应记录等。
4. 遵守法律法规：在工程延期过程中，双方应当遵守相关法律法规的规定，不得通过不正当手段来获取延期时间或损害对方的利益。

工程延期申请中存在重叠时间时一般不能累计算时间。在实际操作中，应当遵循合同约定和法律法规的规定，确保延期时间的合理性和准确性。如果您在工程延期方面遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。