确保生态环境行政处罚程序的公正性，是一个涉及多个环节、需要严格遵循法律法规的复杂过程。以下将从立案、调查取证、案件审查与决定、送达与执行以及结案等关键环节，详细阐述如何确保这一程序的公正性。

一、立案阶段的公正性保障

在立案阶段，确保公正性的关键在于严格审查立案条件，并确保案件来源的多样性和合法性。生态环境部门应通过多种途径发现环境违法行为线索，如日常监督检查、群众举报、媒体曝光等，并对这些线索进行登记和审查。立案条件应明确且严格，包括有证据证明存在涉嫌违反生态环境保护法律法规的违法行为、有明确的违法主体、依法应当或可以给予行政处罚、属于本机关管辖范围等。只有符合这些条件的案件，才能被正式立案，从而确保从源头上保障处罚的公正性。

二、调查取证阶段的公正性保障

调查取证是生态环境行政处罚程序中的核心环节，其公正性直接关系到后续处罚的合法性和合理性。在这一阶段，生态环境部门应指定两名以上具有执法资格的执法人员组成调查组，确保调查的客观性和中立性。调查手段应多样化，包括现场检查、调查询问、收集书证物证等，以确保证据的真实性、关联性和合法性。同时，对于需要专业鉴定的证据，应委托有资质的环境监测机构或聘请专家进行鉴定，以避免主观臆断和误判。

三、案件审查与决定阶段的公正性保障

案件审查与决定阶段是确保生态环境行政处罚程序公正性的关键环节。在这一阶段，法制审核部门应对案件进行全面审核，包括管辖权、违法事实、证据合法性、法律适用、处罚种类和幅度、执法程序等。对于重大、复杂或争议较大的案件，应组织集体审议形成一致意见，以避免个人主观判断对案件处理结果的影响。同时，应充分保障当事人的陈述、申辩及听证权利。在作出处罚决定前，应向当事人送达《行政处罚事先告知书》，告知其违法事实、处罚依据及拟作出的处罚决定，并告知其有权进行陈述、申辩和申请听证。听证程序应公开、公正进行，由非本案调查人员主持，并制作听证笔录和听证报告供处罚决定参考。

四、送达与执行阶段的公正性保障

在送达与执行阶段，确保公正性的关键在于严格按照法定方式送达行政处罚决定书，并确保当事人能够充分了解处罚决定的内容和履行方式。送达方式应多样化，包括直接送达、留置送达、邮寄送达等，以确保当事人能够及时收到处罚决定书。同时，应明确告知当事人履行处罚决定的期限和方式，以及逾期不履行的法律后果。对于逾期不履行且不申请行政复议或提起行政诉讼的当事人，生态环境部门应依法申请人民法院强制执行，以维护法律的权威性和公正性。

五、结案阶段的公正性保障

在结案阶段，确保公正性的关键在于严格审查结案条件，并规范结案手续。结案条件应明确且严格，包括当事人完全履行处罚决定或案件经过复议、诉讼后有最终结果等。只有符合这些条件的案件才能被正式结案。同时，应填写结案审批表并经负责人批准后结案，并将案件相关材料整理归档保存，以备后续查阅和监督。

综上所述，确保生态环境行政处罚程序的公正性需要从立案、调查取证、案件审查与决定、送达与执行以及结案等多个环节入手，严格遵守法律法规和程序规定，充分保障当事人的合法权益和陈述申辩权利。只有这样，才能确保生态环境行政处罚的合法性和公正性，有效打击环境违法行为并维护生态环境的安全和稳定。