针对您提出的问题“本来是建设用地又办理了乡村建设规划许可证，用地手续是否合法”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，我们需要明确的是，建设用地本身并不直接等同于用地手续的合法性。建设用地只是表明了土地的使用性质或规划用途，而用地手续的合法性则取决于是否按照相关法律法规的规定进行了申请、审批和许可。
接下来，我们来看乡村建设规划许可证的作用。根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，在乡、村庄规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设，以及农村村民住宅建设，需要取得乡村建设规划许可证。这一许可证是建设单位或个人进行建设活动的合法依据，也是用地手续合法性的重要组成部分。
现在，我们结合您的情况来具体分析：
如果您的建设用地原本就符合乡、村庄规划的要求，并且您已经按照相关规定向乡、镇人民政府提出了申请，并获得了城市、县人民政府城乡规划主管部门核发的乡村建设规划许可证，那么您的用地手续就是合法的。
如果您的建设用地虽然原本是建设用地，但并不符合乡、村庄规划的要求，或者您没有按照相关规定进行申请和审批，即使您后来办理了乡村建设规划许可证，也可能存在用地手续不合法的问题。不过，这种情况较为特殊，因为通常办理乡村建设规划许可证的前提就是符合规划要求。
另外，还需要注意的是，如果您的建设用地原本属于农用地，那么在办理乡村建设规划许可证之前，还需要依法取得农用地转用审批手续。这是《中华人民共和国土地管理法》的明确规定，也是确保用地手续合法性的重要环节。
综上所述，如果您的建设用地原本就符合乡、村庄规划的要求，并且您已经按照相关规定办理了乡村建设规划许可证（如果涉及农用地转用，还需取得农用地转用审批手续），那么您的用地手续就是合法的。反之，如果存在不符合规划要求或未按规定进行申请和审批的情况，那么用地手续就可能存在不合法的问题。
因此，为了确保用地手续的合法性，建议您在办理相关手续时，务必仔细了解并遵守相关法律法规的规定，确保所有申请和审批流程都符合法定要求。