两人共计诈骗了46万元，且赃款已退还的情况下，仍然可能面临刑事责任，但退赃行为会作为量刑情节予以考虑。以下从不同角度为您详细分析：
一、刑事责任的基本认定
诈骗罪的构成：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条，诈骗公私财物，数额较大的，构成诈骗罪。46万元属于“数额巨大”的范畴，依法应处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
共同犯罪的责任：
- 若两人共同实施诈骗行为，则构成共同犯罪。在共同犯罪中，各被告人需对共同犯罪的全部后果承担责任，除非能证明自己在共同犯罪中起次要或辅助作用（从犯）。
二、退赃对量刑的影响
退赃的法定意义：
- 退赃虽非法定从轻情节，但司法实践中，主动退赃通常会被视为认罪悔罪的表现，从而影响量刑。根据《最高人民法院关于常见犯罪的量刑指导意见》，对于退赃、退赔的，综合考虑犯罪性质、退赃退赔行为对损害结果所能弥补的程度、退赃退赔的数额及主动程度等情况，可以减少基准刑的30%以下。
退赃的实际效果：
- 退赃可能帮助被告人获得从轻或减轻处罚的机会，但具体效果需结合案件其他情节综合判断。例如，若被告人同时具有自首、立功等情节，退赃的从轻效果可能更显著。
三、可能的法律后果
基准刑的确定：
- 根据诈骗数额（46万元），基准刑可能在三年以上十年以下有期徒刑区间内确定。
量刑情节的调整：
- 退赃、认罪认罚、从犯等情节可能共同作用，导致实际量刑低于基准刑。例如，若退赃减少基准刑的20%，认罪认罚减少10%，从犯减少30%，则最终量刑可能大幅降低。
缓刑的适用：
- 若被告人符合缓刑条件（如犯罪情节较轻、有悔罪表现、无再犯危险等），退赃可能增加缓刑适用的可能性。但需注意，诈骗数额巨大时，缓刑适用需严格审查。
四、建议与后续行动
积极配合调查：
- 被告人应如实供述犯罪事实，配合公安机关调查，争取从宽处理。
全额退赃并赔偿：
- 除退赃外，若能积极赔偿被害人损失并取得谅解，可进一步争取从轻量刑。
委托专业律师：
- 刑事案件涉及复杂法律程序和量刑规则，建议委托专业律师介入，制定辩护策略，争取最有利结果。
总结：两人诈骗46万元虽已退赃，但仍可能面临刑事责任。退赃行为会作为量刑情节予以考虑，但具体量刑需结合案件其他情节综合判断。建议积极配合调查、全额退赃并委托专业律师辩护，以争取从轻或减轻处罚。如有进一步法律问题，可直接向我咨询。