针对“经商办企违纪所得不愿上交的处罚”这一问题，首先明确结论：违纪所得不愿上交，将可能面临纪律处分、行政处罚，甚至刑事处罚，具体取决于违纪行为的性质和严重程度。以下从多个角度进行详细分析：
一、纪律处分层面
党内纪律处分：
- 如果违纪者是党员，且其行为违反了党的纪律，根据《中国共产党纪律处分条例》的相关规定，违纪所得应当予以收缴。若拒不上交，将可能面临警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看或开除党籍等纪律处分。
行政纪律处分：
- 对于非党员的公职人员，如果其行为违反了行政纪律，如《中华人民共和国公务员法》或相关行政法规，同样需要上交违纪所得。拒不上交者，可能面临警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等行政处分。
二、行政处罚层面
- 如果违纪行为同时违反了行政法规，如《中华人民共和国反不正当竞争法》、《中华人民共和国税收征收管理法》等，除了纪律处分外，还可能面临行政处罚。行政处罚的种类包括罚款、没收违法所得、责令停产停业、吊销许可证或执照等。若违纪者拒不上交违法所得，行政机关有权依法强制执行。
三、刑事处罚层面
贪污罪或受贿罪：
- 如果违纪行为构成贪污罪或受贿罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，违纪所得不仅应当上交，而且违纪者还将面临刑事处罚。刑罚的种类和幅度取决于贪污或受贿的数额、情节以及造成的后果等因素。若拒不上交违纪所得，将视为拒不认罪悔罪，可能从重处罚。
其他犯罪：
- 如果违纪行为还涉及其他犯罪，如非法经营罪、逃税罪等，同样需要上交违纪所得，并可能面临相应的刑事处罚。
四、实际操作与建议
- 主动上交：一旦发现违纪所得，应主动上交相关部门，以减轻或避免可能的纪律处分、行政处罚或刑事处罚。
- 配合调查：在调查过程中，应积极配合相关部门的工作，如实说明情况，提供证据材料。
- 寻求法律帮助：如果对违纪所得的处理有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
总结来说，经商办企违纪所得不愿上交，将可能面临纪律处分、行政处罚甚至刑事处罚。因此，建议违纪者主动上交违纪所得，并积极配合相关部门的调查工作。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。