在快递工作期间偷拿两个苹果的行为，根据情节轻重可能涉及民事赔偿、行政处罚或刑事责任，具体处理方式需结合实际情况判断。以下分情况详细说明：

1. 若行为定性为“盗窃”，需承担行政或刑事责任

根据《治安管理处罚法》第四十九条，盗窃公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的（如多次盗窃、数额较大等），可能构成《刑法》第二百六十四条规定的盗窃罪。
关键点：

• 两个苹果的价值通常较低（一般不足以达到刑事立案标准，各地标准不同，如上海为2000元），但若存在“多次盗窃”（两年内三次以上）或“入户盗窃”等情节，即使数额小也可能构成犯罪。
  
• 若为初犯且数额极小，公安机关可能以教育为主，要求返还财物或赔偿，但若企业坚持追究，仍可能面临行政处罚。

2. 若行为定性为“侵占”，需承担民事赔偿责任

若苹果属于快递公司所有（如用于包装或员工福利），偷拿行为可能构成《民法典》中的“侵占公司财物”，公司有权要求返还或赔偿损失。
关键点：

• 公司可通过内部规章制度（如员工手册）对轻微违规行为进行处罚（如警告、扣薪），但处罚需合理且符合程序。
  
• 若公司因此解除劳动合同，需符合《劳动合同法》第三十九条“严重违反用人单位规章制度”的规定，否则可能涉及违法解除，员工可主张赔偿。

3. 建议处理步骤

• 立即停止行为：无论情节轻重，偷拿财物均属不当，应主动归还或赔偿。
  
• 与单位沟通：若单位已发现，可主动承认错误并协商处理，避免矛盾升级。
  
• 配合调查：若公安机关介入，如实说明情况，争取从轻处理（如初犯、数额小等情节）。
  
• 法律后果意识：即使金额小，频繁实施类似行为可能累积成“多次盗窃”，面临更严重处罚。

总结：偷拿两个苹果看似小事，但可能涉及法律风险。建议以诚信为本，避免因小失大。若已发生，可主动弥补损失并接受合理处罚；若对处理结果有异议，可进一步向我咨询具体法律程序。