结论：商家在不知情的情况下收到赃款，银行卡确实存在被冻结的可能性，但具体是否冻结需结合案件性质、资金流向及司法机关的判断。以下从法律逻辑和实务角度展开分析：

1. 司法冻结的法律依据与逻辑

根据《刑事诉讼法》第144条，公安机关在侦查刑事案件时，有权冻结与案件有关的财产（包括银行账户），目的是防止犯罪所得被转移或隐匿。关键点在于“与案件有关”，而非单纯以“知情”或“不知情”为标准。

• 若赃款直接流入商家账户，且该资金被认定为犯罪所得（如诈骗款、盗窃款等），司法机关可能认为账户与案件存在关联性，从而启动冻结程序。
  
• 实务中，司法机关通常先冻结账户，再通过调查核实商家是否知情、是否参与犯罪。因此，“不知情”本身不构成阻止冻结的直接理由，但会影响后续责任认定。

2. 商家“不知情”的认定与影响

商家是否知情，是决定其是否承担法律责任的核心因素，但与“是否被冻结”无必然因果关系：

• 若商家能证明不知情（如交易记录合法、无异常行为、配合调查等），冻结可能为临时措施，解冻概率较高。例如，商家提供完整合同、发票等证据，证明资金来源合法，司法机关可能解除冻结。
  
• 若商家无法证明不知情（如交易价格明显低于市场价、频繁接收异常大额转账等），可能被推定为“应当知情”，此时冻结可能持续，甚至面临追缴赃款或行政处罚。

3. 实务中的操作流程与建议

• 冻结阶段：商家收到冻结通知后，应立即联系冻结机关（如公安局经侦部门），要求出具《冻结法律文书》，明确冻结原因、金额及期限。
  
• 申诉阶段：若认为冻结错误，可向冻结机关提交书面异议，附上交易凭证、合同等证据，证明资金合法性。必要时可申请行政复议或提起行政诉讼。
  
• 预防措施：商家应建立合规审查机制，对大额交易、异常客户进行背景调查，保留交易记录，降低被牵连风险。

总结：商家不知情收到赃款，银行卡可能因司法机关的侦查需要被冻结，但最终是否承担责任取决于能否证明自身清白。建议商家在遇到此类情况时，第一时间委托律师介入，通过法律程序维护权益。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。