替代性交通工具费用一般不可以由车主的配偶主张，除非配偶能证明其是该费用的实际支付者或具有法律上的直接利害关系。以下从不同角度进行详细分析：

一、法律关系角度

在交通事故赔偿中，替代性交通工具费用通常被视为因车辆受损而导致的间接损失。根据一般的法律原则，这类损失应由直接受损方，即车主本人来主张。车主作为车辆的所有者或使用者，因交通事故导致车辆无法正常使用，从而产生的替代性交通工具费用，是其因事故而遭受的实际损失，理应由其本人来主张赔偿。

二、配偶主张的例外情况

1. 实际支付者：如果车主的配偶能够证明自己是替代性交通工具费用的实际支付者，例如通过提供支付凭证、发票等证据，那么在这种情况下，配偶可能有一定的权利主张这部分费用。但即便如此，这种主张也更多是基于实际支付的事实，而非基于配偶身份本身。

2. 法律上的直接利害关系：在某些特殊情况下，如果配偶能够证明自己与替代性交通工具费用具有法律上的直接利害关系，例如配偶因车主车辆受损而无法正常使用自己的交通工具，从而产生了额外的交通费用，且这种费用与车主车辆受损具有直接的因果关系，那么配偶可能有一定的权利主张这部分费用。但这种情况较为罕见，且需要充分的证据支持。

三、实际操作建议

1. 车主主张为主：在大多数情况下，替代性交通工具费用应由车主本人来主张。车主应保留好相关证据，如替代性交通工具的使用凭证、费用发票等，以便在需要时向责任方主张赔偿。

2. 配偶协助收集证据：如果配偶希望协助车主主张这部分费用，可以协助车主收集相关证据，如支付凭证、发票等。但配偶本身并不具备直接主张这部分费用的法律权利。

3. 咨询专业律师：如果涉及复杂的法律关系或证据收集问题，建议车主或配偶咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

四、法律后果

如果配偶未经车主同意或未基于实际支付事实、法律上的直接利害关系而擅自主张替代性交通工具费用，可能会面临被责任方拒绝赔偿的风险。此外，如果配偶的行为构成滥用诉讼权利或虚假诉讼等违法行为，还可能承担相应的法律责任。