当机动车与非机动车发生交通事故且双方被认定为同等责任时，关于机动车损坏的赔偿问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、赔偿原则与法律依据
首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险（即交强险）责任限额范围内予以赔偿。交强险是机动车必须购买的强制保险，其赔偿限额包括死亡伤残赔偿限额18万元、医疗费用赔偿限额1.8万元、财产损失赔偿限额0.2万元。
对于超出交强险赔偿限额的部分，由于双方被认定为同等责任，因此一般按照双方各承担50%的比例进行分担（但具体比例可能因地区差异而略有不同，部分地区可能机动车一方承担60%，非机动车一方承担40%）。
二、机动车损坏的赔偿处理
交强险赔付：
- 如果机动车的损坏费用（如维修费）在交强险的财产损失赔偿限额（0.2万元）内，那么这部分费用将全部由交强险赔付。
超出交强险部分的赔付：
- 如果机动车的损坏费用超出了交强险的财产损失赔偿限额，那么超出的部分将按照双方同等责任的比例进行分担。例如，如果超出部分为1万元，且双方各承担50%的责任，那么非机动车方需要赔偿机动车方5000元。
三、赔偿流程与建议
协商：
- 事故发生后，双方应首先尝试通过友好协商解决赔偿事宜。可以就赔偿金额、支付方式等具体细节进行协商，并达成书面协议。
调解：
- 若协商不成，可以寻求第三方调解机构的帮助，如交通管理部门或人民调解委员会。调解机构将协助双方进行沟通，提出合理的赔偿方案，并促成双方达成一致意见。
诉讼：
- 若调解仍无法解决争议，任何一方均有权向人民法院提起诉讼。法院将根据事实和法律规定作出判决，确定双方的赔偿责任和赔偿金额。
注意事项：
- 在处理赔偿问题时，务必保留好相关证据，如车辆维修发票、事故现场照片、交警出具的事故责任认定书等。这些证据将有助于支持您的赔偿请求，并在必要时作为法律依据。
- 确认非机动车方是否购买了相关保险（如非机动车第三者责任险），以及保险的具体条款和赔偿限额。这有助于您更准确地评估自己的赔偿权益。
- 如果您对赔偿问题存在疑问或不确定如何处理，建议及时咨询专业律师的意见。律师将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和指导。
四、特殊情况处理
- 如果非机动车一方存在故意碰撞机动车等情形，机动车一方不承担赔偿责任。但这种情况需要有充分的证据来证明非机动车方的故意行为。
- 在处理赔偿事宜时，双方应充分沟通、积极协商，确保赔偿的公平性和合理性。同时，也要考虑到双方的实际损失情况，包括误工损失、护理费用等（虽然这些主要与人身损害相关，但在全面评估赔偿时也应予以考虑）。
综上所述，当机动车与非机动车发生交通事故且双方负同等责任时，机动车损坏的赔偿问题应依据相关法律法规和实际情况进行具体处理。双方应依法依规进行赔偿，确保自身合法权益得到保障。