结论前置：

1. 一般情况下，持股100%的法人以公司名义转钱给其母亲是不被允许的，这可能构成对公司财产的非法侵占或挪用，违反公司法及相关财务规定。
2. 若存在合法、合理的理由，如支付合法债务、履行法定义务等，并经过公司正式决策流程及符合相关法律法规，则可能被视为合法行为，但需严格遵循法律程序和规定。

法律分析：

首先，我们需要明确的是，公司作为独立的法人实体，其财产与股东（包括持股100%的法人股东）的个人财产是严格分离的。公司的资金应当用于公司的正常经营和业务发展，而非股东的个人用途。

一、非法行为的情况：

若持股100%的法人未经公司正式决策流程（如股东会决议、董事会决议等），擅自以公司名义将资金转给其母亲，这种行为很可能构成对公司财产的非法侵占或挪用。这不仅违反了公司法中关于公司财产独立性的规定，还可能触犯刑法中的挪用资金罪或职务侵占罪等，面临严重的法律后果。

二、合法行为的情况：

当然，也存在一些特殊情况，使得这种转账行为可能被视为合法。例如，如果这笔转账是为了支付公司对其母亲的合法债务（如公司欠其母亲的货款、服务费等），并且这种支付行为经过了公司的正式决策流程，且符合相关法律法规的规定，那么这种行为可能是合法的。但即便如此，也必须确保转账的金额、方式等均符合法律要求，避免出现任何违法违规的情况。

三、法律建议：

1. 严格遵守公司法和相关财务规定：作为公司的法人或股东，应当严格遵守公司法和相关财务规定，确保公司资金的合法使用。
2. 完善公司决策流程：在进行任何涉及公司资金的重大决策时，应当确保经过公司的正式决策流程，如股东会决议、董事会决议等。
3. 咨询专业律师：如果对于某种转账行为是否合法存在疑问，应当及时咨询专业律师，以确保行为的合法性。

四、可能的法律后果：

如果持股100%的法人未经合法程序以公司名义转钱给其母亲，且被认定为非法行为，那么可能面临以下法律后果：

1. 民事责任：公司或其他股东可能要求其返还非法侵占或挪用的资金，并赔偿因此给公司造成的损失。
2. 行政责任：可能受到相关监管部门的行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。
3. 刑事责任：如果行为构成犯罪，如挪用资金罪或职务侵占罪等，可能面临刑事追究，包括有期徒刑、罚金等。

综上所述，持股100%的法人以公司名义转钱给其母亲的行为，在大多数情况下是不被允许的。如果存在合法、合理的理由，也必须严格遵循法律程序和规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。