结论：私企公司公户借款给寺院在法律层面存在一定限制和风险，一般情况下不建议直接操作，需结合具体情形分析。

1. 法律性质与用途限制
   根据《民法典》及《宗教事务条例》，企业资金（包括公户资金）的使用需符合法律法规及企业章程规定。若借款给寺院属于“公益捐赠”，需通过合法捐赠渠道（如宗教活动场所账户）进行，且需确保资金用于宗教活动场所的合法用途（如修缮、文化传播等）。若以“借款”名义直接转账至寺院账户，可能因缺乏合法借贷关系（如无利息约定、无还款计划）被认定为无效行为，甚至涉嫌变相捐赠逃避监管。

2. 税务与合规风险

   • 税务处理：企业公户资金流出需有合法凭证。若以借款名义转账，但无实际借贷合同或利息收入，可能被税务机关质疑资金用途的合理性，进而影响企业所得税扣除或引发税务稽查。
     
   • 宗教事务管理：根据《宗教事务条例》，宗教活动场所接受捐赠需遵守规范流程（如开具合法票据、公开使用情况）。企业直接通过公户借款可能绕过监管，导致资金使用不透明，违反宗教事务管理规定。

3. 操作建议

   • 合规捐赠：若企业意图支持宗教文化事业，建议通过合法捐赠途径（如与寺院签订捐赠协议，明确资金用途，并要求开具财政部门监制的捐赠票据），既可享受税收优惠（如符合条件的公益捐赠可税前扣除），又避免法律风险。
     
   • 避免借贷形式：除非企业与寺院存在真实、合法的借贷关系（如签订借款合同、约定利息及还款期限），否则不建议以“借款”名义转账，否则可能面临合同无效、资金无法追回等风险。
     
   • 内部决策程序：企业需通过股东会或董事会决议，确保资金使用符合公司章程及内部财务管理制度，避免因个人决策导致企业利益受损。

总结：私企公户资金直接借款给寺院存在法律和合规风险，建议通过合规捐赠或真实借贷关系处理。如有具体操作需求，可进一步提供细节，我将为您分析具体方案。