因赌博被罚款5000元、拘留12天，会留下案底。具体情况分析如下：

1. “案底”的法律含义：在我国法律语境中，“案底”通常指犯罪记录，即经法院判决有罪后形成的刑事犯罪记录。而行政处罚记录（如因赌博被罚款、拘留）虽不属于严格意义上的“案底”，但会作为违法记录留存在公安机关的内部系统中，对个人社会信用、职业资格等可能产生间接影响。

2. 赌博行为的法律定性：根据《治安管理处罚法》第七十条，以营利为目的，为赌博提供条件，或参与赌博赌资较大的，处五日以下拘留或五百元以下罚款；情节严重的，处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以上三千元以下罚款。您描述的“罚款5000元、拘留12天”已超出该条款的处罚上限，可能存在两种情况：

   • 合并处罚：若您同时存在多种违法行为（如为赌博提供条件+参与赌博），公安机关可依据《治安管理处罚法》第十六条，对不同违法行为分别决定处罚后合并执行，但拘留期限总和不得超过二十日，罚款亦需在法定幅度内。
     
   • 地方性法规调整：部分地区可能通过地方性法规对赌博行为设定更重的处罚标准（如提高罚款上限），但需以当地公开的法规文件为准。
     无论哪种情况，此类处罚均属于行政处罚，不会直接导致刑事犯罪记录。

3. 行政处罚记录的影响范围：

   • 社会信用体系：根据《国务院关于建立完善守信联合激励和失信联合惩戒制度加快推进社会诚信建设的指导意见》，行政处罚信息可能被纳入公共信用信息平台，影响个人贷款、招投标等社会活动。
     
   • 职业限制：部分职业（如公务员、律师、教师等）在入职或晋升时需提供无违法犯罪记录证明，此时行政处罚记录可能成为审查内容之一。
     
   • 出国签证：部分国家在签证申请中要求申请人提供无犯罪记录证明，行政处罚记录虽不直接等同于犯罪记录，但可能增加签证审查难度。

4. 与刑事犯罪记录的区别：若赌博行为被认定为刑事犯罪（如“赌博罪”或“开设赌场罪”），则需经法院判决有罪，此时会留下真正的“案底”，影响更为深远（如子女政审、部分职业终身禁入等）。但根据您描述的处罚类型（罚款+拘留），目前尚不涉及刑事犯罪。

建议：若您对处罚决定存在异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼；若需了解具体影响或后续处理方式，可进一步向我咨询，我会结合您的实际情况提供专业建议。