检疫员遇到养殖户以欺骗手段开具检疫证明骗取贷款的情况，应当立即采取以下措施，否则可能面临行政责任甚至刑事责任：

1. 立即停止出具证明并纠正错误

若检疫员在不知情的情况下已开具证明，发现欺骗行为后应第一时间撤回或声明原证明无效，防止证明被用于非法贷款。根据《动物防疫法》及《行政许可法》，检疫员对检疫结果的真实性负有直接责任，若因过失导致虚假证明流出，可能被追究行政责任（如警告、记过、降级等）。

2. 固定证据并向上级报告

检疫员需留存养殖户提交的虚假材料（如伪造的养殖记录、动物健康证明等），并形成书面报告提交至单位负责人或农业农村主管部门。根据《动物检疫管理办法》，检疫员发现违法行为后未报告的，可能被认定为“不作为”，面临内部处分。

3. 配合公安机关调查

若养殖户已通过虚假证明骗取贷款，检疫员应主动配合公安机关取证，包括提供检疫记录、监控录像、证人证言等。根据《刑法》第280条，伪造、变造国家机关公文、证件（如检疫证明）骗取贷款的，可能构成“伪造国家机关公文罪”与“骗取贷款罪”数罪并罚，检疫员若参与共谋则可能成为共犯。

4. 自查内部流程漏洞

检疫员需审查自身工作流程，例如是否严格核对养殖户身份、动物数量、健康状况等关键信息，是否留存完整的检疫档案。若因流程疏漏导致欺骗得逞，单位可能被追究“监管失职”责任，检疫员个人也可能因“重大过失”被追责。

5. 法律风险提示

• 行政责任：若检疫员未尽审查义务，可能被处以警告、罚款或吊销检疫资格（《动物防疫法》第87条）。
• 刑事责任：若检疫员与养殖户串通伪造证明，可能构成“滥用职权罪”或“帮助伪造证据罪”（《刑法》第397条、第307条）。
• 民事赔偿：若银行因虚假证明遭受损失，可能起诉检疫员或其单位承担连带赔偿责任。

建议：检疫员应严格遵守“一人一证、一车一证、证物相符”的原则，对可疑申请启动复核程序，必要时可要求养殖户提供担保或第三方验证。若已发生损失，需立即通过单位法律顾问或直接联系我，制定应对方案。