公司员工故意造成公司损失，用人单位可以通过要求员工承担赔偿责任、扣除工资、解除劳动合同并追偿等方式进行追偿。以下是对此问题的详细分析：

一. 员工承担赔偿责任

1. 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
2. 实际应用：若员工故意损坏公司设备、泄露公司机密或进行其他损害公司利益的行为，公司有权依据劳动合同或公司规章制度要求员工赔偿相应的损失。

二. 扣除工资作为赔偿

1. 法律依据：同样依据《工资支付暂行规定》第十六条，经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
2. 注意事项：扣除工资时，需确保扣除后的剩余工资不低于当地月最低工资标准，且需按月支付。

三. 解除劳动合同并追偿

1. 法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，或者严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的，用人单位可以解除劳动合同。
2. 实际应用：对于故意造成公司重大损失的员工，公司可以解除劳动合同，并在解除后通过法律途径继续追偿损失。

四. 追偿流程

1. 确定损失：首先，公司需明确员工造成的具体损失金额和范围。
2. 协商赔偿：与员工进行沟通，尝试达成赔偿协议。
3. 法律途径：若协商不成，公司可通过诉讼或仲裁等法律途径进行追偿。

我建议，在追偿过程中，公司应确保有充分的证据证明员工的故意行为以及由此造成的损失，以便在法律程序中维护自身的合法权益。同时，公司也应完善内部管理制度，加强员工培训和监管，预防类似事件的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。