农民工被克扣工资，最直接且有效的解决途径是向当地劳动监察部门投诉，同时也可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、向当地劳动监察部门投诉
法律依据：
- 根据《劳动保障监察条例》的相关规定，劳动保障行政部门对用人单位遵守劳动保障法律、法规和规章的情况进行监督检查，对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，有权依法予以查处。
操作流程：
- 农民工可以携带相关证据（如工资条、考勤记录、工作证等）到当地劳动监察部门进行投诉。
- 劳动监察部门在接到投诉后，会进行调查核实，并根据调查结果依法作出处理决定。
优势：
- 劳动监察部门具有行政执法权，能够直接对用人单位进行查处，效率较高。
- 投诉过程相对简单，不需要农民工承担过多的法律费用和时间成本。
二、申请劳动仲裁
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者与用人单位发生劳动争议，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
操作流程：
- 农民工需要准备仲裁申请书、相关证据材料等，并提交给当地劳动争议仲裁委员会。
- 仲裁委员会在接到申请后，会组织双方进行调解或开庭审理，并根据审理结果作出仲裁裁决。
优势：
- 劳动仲裁具有法律效力和强制执行力，一旦裁决生效，用人单位必须履行。
- 仲裁过程相对公正、透明，能够保障农民工的合法权益。
三、提起诉讼
法律依据：
- 如果农民工对劳动仲裁结果不满意，或者用人单位不履行仲裁裁决，农民工可以向人民法院提起诉讼。
操作流程：
- 农民工需要准备起诉状、相关证据材料等，并提交给有管辖权的人民法院。
- 法院在接到起诉后，会组织双方进行庭审，并根据庭审结果作出判决。
优势：
- 诉讼是最终的救济途径，能够确保农民工的合法权益得到最大程度的保障。
- 法院判决具有最高的法律效力，用人单位必须履行。
四、其他建议
保留证据：
- 农民工在平时工作中，应该注意保留与工资相关的证据，如工资条、考勤记录、工作证等，以便在维权时提供有力支持。
寻求法律援助：
- 如果农民工在维权过程中遇到困难，可以寻求当地法律援助机构的帮助，获得免费的法律咨询和代理服务。
集体维权：
- 如果有多名农民工被同一用人单位克扣工资，可以考虑集体维权，通过联合投诉、申请仲裁或提起诉讼等方式，提高维权效率。