结论前置：针对正在执行的标的建设方未移交厂房的情况，可按以下思路处理：

1. 核查执行依据与合同条款
   首先需确认执行依据（如生效判决、仲裁裁决或执行裁定书）中是否明确要求建设方移交厂房。若判决主文仅要求支付工程款或确认所有权，而未明确移交义务，则需通过补充执行申请或另诉要求履行移交义务解决。
   若合同（如施工合同、买卖合同）中明确约定了移交时间、方式及违约责任，可直接依据合同条款主张权利，要求建设方承担逾期移交的违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。

2. 申请法院强制执行移交
   若执行依据已明确移交义务，但建设方拒不履行，可向执行法院提交《强制执行申请书》，要求法院：

   • 责令建设方限期移交厂房；
     
   • 对拒不履行的行为采取罚款、拘留等强制措施；
     
   • 若厂房被第三方占用，可追加实际占有人为被执行人，或要求法院排除妨碍。
     关键点：需提供厂房现状证据（如照片、视频、占有使用证明），证明建设方未履行移交义务。

3. 处理厂房被第三方占有的情形
   若厂房已被建设方转让、出租或抵押给第三方，需分情况处理：

   • 合法转让：若第三方已办理产权变更登记，可能涉及“执行标的错误”，需通过执行异议之诉撤销原执行裁定；
     
   • 无权处分：若第三方未支付合理对价或明知厂房存在纠纷，可主张转让行为无效，要求返还厂房；
     
   • 租赁关系：根据“买卖不破租赁”原则，若租赁合同成立于查封前，需尊重租赁权；若成立于查封后，可要求解除租赁合同并移交。

4. 追究建设方的违约或侵权责任
   若因未移交厂房导致损失（如租金损失、生产停滞损失），可：

   • 依据合同约定主张违约金；
     
   • 无约定时，按实际损失主张赔偿（需提供损失计算依据，如审计报告、合同等）；
     
   • 若建设方恶意转移财产，可申请法院撤销其处分行为（如低价转让）。

行动建议：

• 立即整理执行依据、合同、沟通记录等证据；
  
• 向执行法院提交《执行行为异议申请书》或《案外人执行异议申请书》（视情况）；
  
• 同步准备另诉材料，以防执行程序无法直接解决。
  

如有进一步细节（如厂房产权状态、执行阶段等），可直接向我咨询，我会结合具体案情提供方案。