集体合同中确实可以包含特别条款。集体合同作为企业职工一方与用人单位就劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利等事项，通过平等协商达成的书面协议，其内容具有相当的灵活性和广泛性。

集体合同内容概述

根据《集体合同规定》第八条，集体协商双方可以就多项或某项内容进行集体协商，签订集体合同或专项集体合同。这些内容包括但不限于：

1. 劳动报酬：涉及工资水平、工资分配制度、工资标准和工资分配形式等。
2. 工作时间：包括工作时间的安排、加班及休息休假等。
3. 劳动安全与卫生：确保工作场所的安全和卫生条件。
4. 保险福利：涵盖社会保险、福利待遇等。
5. 其他内容：双方认为应当协商的其他事项，这实际上为特别条款的设定提供了空间。

特别条款的设定

特别条款通常指的是针对特定情况或特定事项所设定的条款。在集体合同中，这些特别条款可能涉及：

1. 女职工和未成年工特殊保护：针对女职工和未成年工的特殊工作条件和保护措施。
2. 职业技能培训：规定用人单位应提供的职业技能培训内容和方式。
3. 劳动合同管理：对劳动合同的签订、变更、解除和终止等事项作出特别规定。
4. 行业性或区域性特别规定：在行业性或区域性集体合同中，可能针对特定行业或地区的特殊情况设定特别条款。

特别条款的效力与审查

集体合同中的特别条款，一旦经双方协商一致并签订，即具有法律效力。这些条款不仅约束用人单位和职工双方，还可能对行业内的其他企业产生示范效应。同时，集体合同需要经过劳动保障行政部门的审查，以确保其内容的合法性和合理性。在审查过程中，特别条款也会受到严格的审视，以确保其不违反法律法规的强制性规定。

实际应用中的考虑

在实际应用中，设定特别条款时需要考虑以下几点：

1. 合法性：特别条款的内容必须符合法律法规的强制性规定，不得侵犯职工的合法权益。
2. 合理性：特别条款的设定应当合理，既要考虑用人单位的生产经营需要，也要兼顾职工的合法权益。
3. 协商一致：特别条款的设定必须经过双方协商一致，任何一方不得单方面强制设定。

举例来说，如果一家企业处于特定行业，该行业对女职工有特殊的保护需求，那么在集体合同中就可以设定关于女职工特殊保护的特别条款，如规定女职工在孕期、产期和哺乳期的特殊待遇等。

综上所述，集体合同中可以包含特别条款，这些条款的设定需要遵循合法性、合理性和协商一致的原则。如果你在集体合同的签订或执行过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。