单位因违建被罚款，一般不能申请财政支付。以下是具体分析：
财政资金的使用原则
财政资金主要用于公共服务和民生支出，如教育、医疗、基础设施建设等。根据《预算法》及相关财政管理规定，财政资金不得用于违法违规行为的支出，包括因单位自身违法行为产生的罚款。违建罚款属于对违法行为的惩戒，应由违法主体（即单位）自行承担。
单位责任与财政支付的区别
单位作为独立法人，需对其违法行为负责。若单位因违建被罚款，罚款应纳入单位财务支出，由单位自有资金或预算安排解决。财政支付通常针对合法合规的公共支出，而非弥补单位违法成本。若单位试图通过财政资金支付罚款，可能涉及挪用公款或违反财政纪律，需承担相应法律责任。
特殊情况下的处理
极少数情况下，若违建行为与政府指令或公共利益直接相关（如政府要求单位临时搭建用于应急），且罚款金额较大，单位可尝试通过行政复议或诉讼主张减免罚款。但即便如此，财政资金直接支付罚款仍缺乏法律依据，通常需通过其他合法途径（如政府补贴、项目专项资金）间接解决，且需严格符合财政审批程序。
建议：单位应优先通过自有资金支付罚款，避免因违规使用财政资金引发更严重的法律风险。若对罚款合法性或金额有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。