结论：公司法人代表（通常也是公司股东之一）可以将其持有的全部股权转让给其两个儿子，但这一过程需要遵循公司法和相关法律法规的规定，并确保程序合法合规。
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，股东有权依法转让其股权。这意味着，作为公司股东的法人代表，有权将其持有的股权进行转让，包括转让给其亲属，如儿子。然而，股权转让并非简单的个人行为，它涉及到公司其他股东的权益、公司治理结构以及可能涉及的税务问题，因此必须遵循一定的法律程序。
二、股权转让的程序与要点
内部决策程序：
- 股东会决议：如果公司章程对股权转让有特别规定，或者转让行为可能影响到公司其他股东的权益，那么通常需要召开股东会进行决议。在决议中，应明确转让的股权比例、受让方、转让价格等关键条款。
- 优先购买权：根据《公司法》的规定，其他股东在同等条件下享有优先购买权。因此，在转让前，应确保其他股东已经放弃了优先购买权，或者已经按照法定程序行使了优先购买权。
签订股权转让协议：
- 协议内容：股权转让协议应明确双方的权利义务，包括转让的股权比例、转让价格、支付方式、违约责任等。
- 合法合规：协议内容应合法合规，不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害公司、其他股东或债权人的利益。
办理工商变更登记：
- 提交材料：股权转让完成后，应及时向工商行政管理部门提交相关材料，包括股权转让协议、股东会决议、公司章程修正案等，以办理工商变更登记手续。
- 公示效力：工商变更登记完成后，股权转让行为即具有公示效力，对外产生法律效力。
三、可能涉及的法律后果与风险
程序不合规的风险：
- 如果股权转让程序不合规，如未召开股东会、未履行优先购买权程序等，可能导致股权转让行为无效或被撤销。
- 这将给转让方和受让方带来不必要的法律纠纷和经济损失。
税务风险：
- 股权转让可能涉及所得税、印花税等税务问题。如果未按照规定缴纳税款，可能面临税务机关的处罚。
- 因此，在股权转让前，应咨询专业税务机构或律师，了解相关税务政策并合规操作。
对公司治理结构的影响：
- 股权转让后，公司的治理结构可能发生变化。如果受让方（如法人代表的儿子）不具备相应的管理能力或经验，可能对公司的经营产生不利影响。
- 因此，在股权转让前，应充分考虑受让方的资质和能力，确保公司治理结构的稳定性和有效性。
四、建议与操作指南
咨询专业律师：
- 在进行股权转让前，建议咨询专业律师，了解相关法律法规和程序要求，确保股权转让的合法性和合规性。
完善公司章程：
- 如果公司章程对股权转让有特别规定，应确保股权转让行为符合公司章程的要求。同时，也可以考虑在公司章程中明确股权转让的程序和要求，以减少后续纠纷。
注意税务筹划：
- 在进行股权转让时，应注意税务筹划，合理利用税收优惠政策，降低税务成本。同时，也应确保按照规定缴纳税款，避免税务风险。
作为李再庆律师，我建议您在处理此类股权转让事宜时务必谨慎行事，确保所有程序合法合规。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。