针对您提出的问题“大件运输护送车辆未按照护送方案配置的怎么处罚”，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据
大件运输车辆若未按照护送方案配置护送车辆，将违反《道路交通安全法》及《超限运输车辆行驶公路管理规定》等相关法规。这些法规明确规定，大件运输车辆在运输过程中必须按照许可的护送方案采取护送措施，以确保道路交通安全和通行秩序。
二、处罚措施
警告： 对于轻微违法行为，交通管理部门可能首先给予警告，以提醒驾驶员或运输企业严格遵守规定。
罚款： 罚款是常见的处罚方式之一。具体罚款金额可能因地区及违法情节的不同而有所差异。例如，在某些地区，对初次违规且情节较轻的，可能处以较低罚款（如500元）；而对于情节严重者，罚款可能高达3000元或更多。如您所提到的案例中，该公司因未按照许可的护送方案采取护送措施，被依法罚款3000元。
责令改正： 交通管理部门有权要求运输企业或驾驶员停止运输，直至按规定配备护送车辆后，方允许继续运输。这是为了确保运输过程的安全性和合法性。
扣留车辆： 对于拒不改正或严重违法的行为，执法部门有权扣留大件运输车辆，直至违法行为得到纠正。这是一种较为严厉的处罚措施，旨在强制运输企业或驾驶员遵守规定。
暂扣或吊销驾驶证： 针对严重或多次违法的驾驶员，交通管理部门可采取暂扣或吊销驾驶证的严厉措施。这是为了维护道路交通安全，防止违法驾驶员继续从事危险运输活动。
三、其他法律后果
除了上述行政处罚外，若因未配护送车导致交通事故，造成他人损失，责任人还需承担相应的民事赔偿责任。在极端情况下，如未配护送车行为构成犯罪（如危害公共安全），责任人还将面临刑事处罚。
四、建议与指导
严格遵守规定： 大件车驾驶员和运输企业应熟知并严格遵守道路交通安全法规及大件运输规定，确保运输过程的安全性和合法性。
配备护送车： 在运输大件物品时，必须按要求配备护送车辆，以保障道路安全和通行秩序。不要因节约成本而忽视安全规定。
加强培训教育： 定期对驾驶员进行道路交通安全法规培训，提高安全意识和法律意识。这有助于减少违法行为的发生，保障道路交通安全。
了解当地法规： 因各地处罚标准可能不同，建议提前了解并遵守当地关于大件运输的具体规定。这有助于避免因不了解当地法规而导致的违法行为。
综上所述，大件运输护送车辆未按照护送方案配置将面临多重法律后果。因此，务必严格遵守相关规定，确保运输安全合法。