交通事故赔偿约定商事仲裁是有效的。以下从不同角度为您详细分析：

一、仲裁协议的法律效力

根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，仲裁协议是当事人自愿将争议提交仲裁机构进行裁决的书面约定。只要仲裁协议符合法定形式要件（如书面形式、明确仲裁事项、选定仲裁委员会等），且不存在无效情形（如无民事行为能力人订立的、一方采取胁迫手段迫使对方订立的等），则该仲裁协议对双方当事人具有法律约束力。在交通事故赔偿纠纷中，如果双方当事人自愿签订了有效的仲裁协议，并约定将赔偿争议提交商事仲裁机构裁决，那么该仲裁协议就是有效的。

二、商事仲裁的适用性

商事仲裁机构通常具备专业的仲裁员队伍和完善的仲裁规则，能够高效、公正地处理各类商事纠纷，包括交通事故赔偿纠纷。只要仲裁协议中明确约定了将争议提交商事仲裁机构裁决，且该仲裁机构愿意受理该案件，那么商事仲裁就是适用的。在仲裁过程中，仲裁庭将依据事实和法律，对双方当事人的争议进行裁决，该裁决具有终局性，对双方当事人均有约束力。

三、仲裁裁决的执行

一旦仲裁庭作出裁决，该裁决就具有法律效力。如果一方当事人不履行裁决，另一方当事人可以向有管辖权的人民法院申请强制执行。这意味着，通过商事仲裁解决交通事故赔偿纠纷，不仅能够获得公正的裁决结果，还能够确保裁决结果得到有效执行。

四、注意事项

1. 确保仲裁协议的有效性：在签订仲裁协议时，双方当事人应确保协议内容明确、具体，且符合法定形式要件。避免出现因协议内容模糊或形式要件缺失而导致仲裁协议无效的情况。
2. 选择合适的仲裁机构：双方当事人应根据争议的性质和实际情况，选择具有专业性和公信力的仲裁机构进行仲裁。这有助于确保仲裁过程的公正性和裁决结果的有效性。
3. 遵守仲裁程序：在仲裁过程中，双方当事人应严格遵守仲裁程序和相关规定，积极配合仲裁庭的工作。这有助于确保仲裁过程的顺利进行和裁决结果的及时作出。

建议：如果您在交通事故赔偿纠纷中约定了商事仲裁，请确保仲裁协议的有效性，并选择合适的仲裁机构进行仲裁。在仲裁过程中，请遵守仲裁程序和相关规定，以确保您的权益得到有效维护。如果您在仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。