针对您提出的“土地权属证书加盖政府章与加盖政府土地登记专用章哪个合法有效”的问题，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，土地权属证书的合法性和有效性，并不完全取决于所加盖的印章是政府章还是政府土地登记专用章，而是取决于该印章是否被依法授权使用，并且是否在规定的范围内被正确使用。
以汕尾市人民政府为例，根据《汕尾市人民政府关于授权汕尾市国土资源局管理使用汕尾市人民政府土地登记专用章的通知》（汕府〔2013〕36号）文件，我们可以了解到以下几点关键信息：
授权使用：汕尾市人民政府授权汕尾市国土资源局管理使用汕尾市人民政府土地登记专用章，这意味着该专用章在土地登记、发证等特定场合下，具有与汕尾市人民政府公章同等的法律效力。
使用范围：该专用章仅限用于土地登记、发证中代替汕尾市人民政府公章。这表明，在土地权属证书的颁发过程中，如果符合相关规定和程序，加盖政府土地登记专用章是合法且有效的。
管理要求：汕尾市国土资源局需严格管理、使用该专用章，确保专人保管，并按照证章分离的原则进行操作。这进一步保证了专用章使用的规范性和安全性。
法律效力：由于该专用章被依法授权使用，并且在规定的范围内被正确使用，因此它所加盖的土地权属证书在法律上是有效的。
综上所述，无论是加盖政府章还是政府土地登记专用章，只要该印章是被依法授权使用，并且在规定的范围内被正确使用，那么所颁发的土地权属证书都是合法有效的。在实际操作中，具体使用哪种印章，通常取决于当地政府或相关部门的授权和规定。
因此，对于您的问题，不能简单地一概而论说政府章就比政府土地登记专用章更合法有效，或者反之。关键在于查看该印章是否被依法授权，并且是否在规定的范围内被正确使用。如果您对具体的土地权属证书有疑问，建议咨询当地国土资源部门或相关法律机构以获取更准确的解答。