协议书盖章的选择主要取决于协议的主体性质和协议的具体内容，一般来说，可以选择盖公章、合同专用章或法人章。以下是对这几种章的详细解释和适用情况：

1. 公章：

   • 法律效力：公章代表法人，具有最高的法律效力。它体现了法人对协议内容的全面认可和承担相应法律责任的意愿。
   • 适用情况：一般适用于以法人名义签订的各类协议，特别是那些涉及法人整体意志和重大利益的协议。使用公章能全面代表法人意志，对外具有最强的证明力。

2. 合同专用章：

   • 法律效力：合同专用章专门用于签订合同等协议，表明该协议是基于合同关系。它具有明确的合同性质，在处理合同相关事务时使用较为合适。
   • 适用情况：如果协议明确是合同类协议，且需要突出其合同性质，那么使用合同专用章是很合适的选择。它能突出协议的合同性质，便于在合同纠纷中明确双方的权利和义务。

3. 法人章：

   • 法律效力：法人章即法定代表人的个人印章。在一些特定情况下，如法定代表人亲自签署协议时，加盖法人章可起到确认身份和代表法人意思表示的作用。
   • 适用情况：法人章通常在法定代表人直接参与签署协议时使用，比如一些较为简单的协议补充说明等。它以法定代表人的身份进行签署确认，体现了法定代表人对协议内容的认可。

在选择盖章时，还需要注意以下几点：

• 确保章的真实性和有效性：盖章时要确保所使用的章是真实有效的，避免使用伪造或过期的章。
• 符合单位的印章使用管理规定：盖章过程要符合单位的印章使用管理规定，确保盖章行为的规范性和合法性。
• 仔细审核协议内容：在盖章前，还应仔细审核协议内容，确保符合公司利益和法律要求，避免因协议内容违法或损害公司利益而引发法律纠纷。

举例说明：

• 如果是一家公司与其他公司签订合作协议，那么通常应该使用公司的公章或合同专用章来盖章，以体现公司对协议内容的认可和承担相应法律责任的意愿。
• 如果是公司的法定代表人亲自签署一份补充协议，那么可以在协议上加盖法人章来确认其身份和代表法人意思表示。

最后需要强调的是，不同章的使用应根据具体情况和协议性质来合理选择。如果有任何疑问或不确定的地方，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。