结论是：在已经提出离职但尚未正式离职的情况下，若发现患有肺结核，员工有权不离职并申请休病假。以下是详细分析：
一、医疗期内的法律保护
医疗期的定义：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，用人单位不得因此解除劳动合同的期限。
医疗期的长度：
- 医疗期的具体长度根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3个月到24个月。在此期间，员工享有病假工资或疾病救济费，且用人单位不得解除劳动合同。
肺结核与医疗期：
- 肺结核属于乙类传染病，但并非所有肺结核患者都构成职业病。不过，无论是否构成职业病，只要员工处于法定医疗期内，用人单位就不得随意解除劳动关系。
二、已提出离职但未正式离职的情况
离职申请的撤销：
- 在员工正式离职前，如果其健康状况发生变化，如发现患有肺结核，且需要治疗休息，员工有权撤销之前的离职申请，并申请休病假。
用人单位的责任：
- 用人单位在收到员工的病假申请后，应按照相关规定安排员工接受治疗，并支付病假工资或疾病救济费。同时，用人单位不得因员工患病而解除劳动合同。
三、实际操作建议
及时告知用人单位：
- 员工在发现患有肺结核后，应及时告知用人单位，并按照单位规定提交病假申请手续。
保留相关证据：
- 员工应妥善保留相关的医疗证明、病假申请记录等，作为日后可能需要的法律证据。
了解自身权益：
- 员工应深入了解相关法律法规，明确自己在医疗期内的权益，以便在必要时依法维护自己的合法权益。
四、特殊情况的处理
如果医疗期满后仍不能从事原工作：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条，如果医疗期满后，员工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以提前30日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者1个月工资后，解除劳动合同。但在此情况下，用人单位仍需按照相关规定向劳动者支付经济补偿金。
如果肺结核被认定为职业病：
- 如果员工所患肺结核被认定为职业病或与工作相关，那么用人单位更无权单方面解除合同。即使医疗期满，用人单位也需根据员工的实际情况安排合适的工作岗位或提供必要的支持。
总结来看，在已经提出离职但尚未正式离职的情况下，若发现患有肺结核，员工有权不离职并申请休病假。用人单位应尊重员工的合法权益，按照相关规定安排员工接受治疗并支付病假工资或疾病救济费。如果员工在医疗期满后仍不能从事原工作或单位另行安排的工作，用人单位可以依法解除劳动合同，但需支付经济补偿金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。